10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0908 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0908  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000484468  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0349  hypothetical protein  41.25 
 
 		 240 aa  199  3e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1969  ABC-2 type transporter  30.49 
 
 		 241 aa  125  8.000000000000001e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00000398406  hitchhiker  0.000000000710377 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2151  ABC-2 type transport system, membrane protein  33.33 
 
 		 241 aa  123  2e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.148287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0220  ABC-2 type transport system, membrane protein  30.12 
 
 		 241 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0612371 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1079  ABC-2 type transporter  32.93 
 
 		 239 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0486058 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1211  ABC-2 type transporter  35.15 
 
 		 251 aa  115  6e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0428455 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1779  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.496998  normal  0.210099 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1474  ABC-2 type transporter  26.24 
 
 		 243 aa  45.8  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.168622  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0173  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 237 aa  43.5  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00869778  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>