17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0279 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0279  conserved hypothetical protein  100 
 
 
96 aa  191  3e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1258  hypothetical protein  36.96 
 
 
92 aa  63.2  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0254371  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1267  hypothetical protein  40.22 
 
 
108 aa  57.4  0.00000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.751557  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0187  hypothetical protein  36.59 
 
 
88 aa  54.7  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.249971  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1573  hypothetical protein  40.43 
 
 
94 aa  53.1  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0116565 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0644  transcriptional regulator protein-like protein  30.85 
 
 
130 aa  50.1  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0330  hypothetical protein  37.33 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000040093  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0902  hypothetical protein  34.67 
 
 
83 aa  49.7  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0939  hypothetical protein  34.25 
 
 
85 aa  48.5  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0341547  hitchhiker  0.000571879 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2076  hypothetical protein  34.33 
 
 
104 aa  47.4  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00255603  normal  0.587039 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0780  conserved hypothetical protein  37.33 
 
 
100 aa  47  0.00008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.482824  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0027  hypothetical protein  32.88 
 
 
85 aa  44.3  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0718  hypothetical protein  30.49 
 
 
86 aa  43.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.965129  hitchhiker  0.000000000542422 
 
 
-
 
NC_002936  DET1376  hypothetical protein  38.16 
 
 
93 aa  42.7  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000415589  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1157  hypothetical protein  38.16 
 
 
93 aa  42.7  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000220051  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1187  hypothetical protein  34.21 
 
 
93 aa  40.4  0.007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00137424  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0651  hypothetical protein  30.26 
 
 
86 aa  40.4  0.008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>