11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0248 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0248  Ribosomal protein L13e  100 
 
 		 110 aa  223  8e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0734  ribosomal protein L13  54 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0451901  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1663  ribosomal protein L13  58.7 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.129766  hitchhiker  0.00645105 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0588  50S ribosomal protein L13E  47.06 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0690  ribosomal protein L13  44.93 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1980  ribosomal protein L13  52 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.280522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0678  ribosomal protein L13  42.03 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01020  ribosomal protein L13, putative  35.29 
 
 		 205 aa  47  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.243164  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48494  60S ribosomal protein L13  34.18 
 
 		 202 aa  42.4  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0593553 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15619  predicted protein  37.68 
 
 		 171 aa  42.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.925948  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15603  Ribosomal protein L13, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  38.16 
 
 		 221 aa  40.8  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>