16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2791 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2791  hypothetical protein  100 
 
 		 806 aa  1621    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3330  hypothetical protein  32.56 
 
 		 783 aa  343  1e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0454731  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0150  spermidine synthase-like  29.11 
 
 		 812 aa  303  6.000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2865  hypothetical protein  29.16 
 
 		 819 aa  286  7e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0368958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4279  hypothetical protein  30.07 
 
 		 818 aa  265  3e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0453  hypothetical protein  26.7 
 
 		 828 aa  206  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0793  hypothetical protein  27.25 
 
 		 827 aa  198  4.0000000000000005e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.526313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4224  hypothetical protein  24.73 
 
 		 821 aa  180  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.965892 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2180  hypothetical protein  24.91 
 
 		 889 aa  133  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.786018 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2931  hypothetical protein  25.6 
 
 		 766 aa  84  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0187375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  23.57 
 
 		 1078 aa  48.9  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  23.14 
 
 		 1079 aa  47.8  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  23.62 
 
 		 1078 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3413  Spermidine synthase-like protein  29.31 
 
 		 681 aa  44.7  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.730337  normal  0.555353 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  20.96 
 
 		 541 aa  44.7  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2030  Spermine synthase  22.92 
 
 		 510 aa  44.3  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>