15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8773 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8773  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  370  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1777  hypothetical protein  49.14 
 
 
177 aa  174  8e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.3428  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2236  hypothetical protein  38.51 
 
 
185 aa  133  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000422278  hitchhiker  0.00000960297 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1495  hypothetical protein  40.27 
 
 
240 aa  124  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2605  hypothetical protein  33.56 
 
 
262 aa  85.1  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5652  hypothetical protein  30.77 
 
 
257 aa  80.5  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.372875 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2908  hypothetical protein  24.64 
 
 
256 aa  76.3  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2425  hypothetical protein  31.72 
 
 
264 aa  75.5  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15050  hypothetical protein  30.67 
 
 
176 aa  75.5  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197348  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2111  hypothetical protein  25.37 
 
 
175 aa  61.6  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2347  hypothetical protein  25.19 
 
 
145 aa  57  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.248905 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0373  hypothetical protein  23.24 
 
 
151 aa  55.8  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.296115 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1361  hypothetical protein  28.99 
 
 
206 aa  50.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5622  hypothetical protein  33.07 
 
 
272 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00291531  normal  0.165564 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5806  hypothetical protein  33.07 
 
 
272 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000133808 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>