16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7022 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7022  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  324  3e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0945263 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0715  hypothetical protein  55.91 
 
 		 149 aa  136  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.100612  normal  0.0883598 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02760  hypothetical protein  38.89 
 
 		 164 aa  97.4  7e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.29947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4471  hypothetical protein  36.36 
 
 		 155 aa  83.6  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2459  beta-lactamase domain protein  40.62 
 
 		 479 aa  73.9  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3773  hypothetical protein  34.43 
 
 		 259 aa  72.4  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0606  competence-like protein  36.46 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.216559  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  39.36 
 
 		 1931 aa  68.9  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1713  beta-lactamase domain-containing protein  35.16 
 
 		 421 aa  64.3  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1867  beta-lactamase domain protein  33 
 
 		 477 aa  54.7  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0121854 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0008  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.63 
 
 		 398 aa  52  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.203843  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0108  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.6 
 
 		 420 aa  52.4  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.94824  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1905  hypothetical protein  35.16 
 
 		 333 aa  50.8  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.432179 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1261  nuclease (SNase domain protein)  31.9 
 
 		 301 aa  48.9  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2261  hypothetical protein  25.49 
 
 		 331 aa  45.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000590527  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1403  hypothetical protein  34.65 
 
 		 598 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>