54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5171 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5171  hypothetical protein  100 
 
 		 594 aa  1209    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0902166  hitchhiker  0.00324172 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2098  hypothetical protein  66.67 
 
 		 351 aa  434  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.217218  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2097  hypothetical protein  37.36 
 
 		 518 aa  224  3e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.92303  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3136  hypothetical protein  36.77 
 
 		 356 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1877  hypothetical protein  38.22 
 
 		 519 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2983  hypothetical protein  37.05 
 
 		 356 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4187  hypothetical protein  36.44 
 
 		 366 aa  218  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.637966  hitchhiker  0.00122785 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5987  hypothetical protein  37.4 
 
 		 370 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.373978 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0631  hypothetical protein  37.97 
 
 		 343 aa  198  3e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.107314  normal  0.14851 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1178  protein of unknown function DUF1271  45.29 
 
 		 233 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.25383  normal  0.606867 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2314  hypothetical protein  43.44 
 
 		 232 aa  189  2e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2509  hypothetical protein  38.46 
 
 		 367 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.607517  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3576  hypothetical protein  41.7 
 
 		 256 aa  179  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.327098  normal  0.196355 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1281  protein of unknown function DUF1271  41.89 
 
 		 233 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.768741  normal  0.722249 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1475  protein of unknown function DUF1271  39.91 
 
 		 233 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0145  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  33.19 
 
 		 236 aa  158  3e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2298  hypothetical protein  39.55 
 
 		 241 aa  157  7e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.561327 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0591  zinc finger CDGSH-type domain protein  35.59 
 
 		 229 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2058  zinc finger CDGSH-type domain protein  34.22 
 
 		 246 aa  148  3e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000110219  normal  0.493607 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0865  protein of unknown function DUF1271  35.56 
 
 		 219 aa  144  5e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000589964  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0289  hypothetical protein  32.35 
 
 		 409 aa  127  5e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.929671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0383  hypothetical protein  33.13 
 
 		 384 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.543894  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2272  hypothetical protein  31.68 
 
 		 211 aa  104  5e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0871  protein of unknown function DUF1271  31.36 
 
 		 599 aa  103  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207432  normal  0.190699 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2702  hypothetical protein  37.23 
 
 		 384 aa  101  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2855  hypothetical protein  36.8 
 
 		 384 aa  100  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0539243  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1097  hypothetical protein  36.8 
 
 		 384 aa  99.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0782  protein of unknown function DUF1271  33.33 
 
 		 214 aa  97.1  9e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0516  hypothetical protein  31.62 
 
 		 211 aa  85.1  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1270  hypothetical protein  29.18 
 
 		 215 aa  85.1  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.7318  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2330  VioB - polyketide synthase  28.33 
 
 		 1069 aa  79.3  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0866221  hitchhiker  0.0021675 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4291  hypothetical protein  27.31 
 
 		 324 aa  70.9  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1437  protein of unknown function DUF1271  31.25 
 
 		 147 aa  61.6  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.781813  normal  0.13067 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2069  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  46.15 
 
 		 146 aa  54.7  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3258  Zinc finger, CDGSH-type  43.75 
 
 		 86 aa  54.3  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.167004  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0355  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  48.84 
 
 		 72 aa  54.7  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2496  hypothetical protein  48 
 
 		 86 aa  53.9  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.242618  normal  0.220386 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13110  iron-binding zinc finger protein, CDGSH type  52 
 
 		 104 aa  50.4  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2157  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  50 
 
 		 71 aa  50.1  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3589  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  46.05 
 
 		 84 aa  50.4  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.558971  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1261  hypothetical protein  23.99 
 
 		 763 aa  50.1  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0466  Iron sulfur domain-containing, CDGSH-type  38.03 
 
 		 77 aa  49.3  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.336392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5202  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  55.26 
 
 		 66 aa  48.5  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1411  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  86.36 
 
 		 53 aa  48.1  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0321891 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0783  Iron sulfur domain-containing, CDGSH-type  47.73 
 
 		 76 aa  47.8  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.396298  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0622  Iron sulfur domain-containing, CDGSH-type  56.41 
 
 		 68 aa  47.8  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.507556 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3395  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  41.18 
 
 		 104 aa  47.4  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64895  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3158  zinc finger CDGSH-type domain protein  37.66 
 
 		 74 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000868245 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2809  zinc finger CDGSH-type domain protein  37.66 
 
 		 74 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2269  zinc finger CDGSH-type domain protein  45 
 
 		 70 aa  46.6  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2759  zinc finger CDGSH-type domain protein  41.46 
 
 		 65 aa  46.6  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2912  hypothetical protein  40 
 
 		 75 aa  45.8  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.213928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4406  hypothetical protein  36.84 
 
 		 74 aa  45.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00107323  normal  0.281597 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1986  zinc finger CDGSH-type domain protein  36.84 
 
 		 90 aa  44.3  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>