29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4984 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4984  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  229  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3900  hypothetical protein  69.72 
 
 		 114 aa  160  7e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.8573 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2612  hypothetical protein  65.45 
 
 		 115 aa  151  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3239  hypothetical protein  63.55 
 
 		 114 aa  142  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1470  hypothetical protein  62.96 
 
 		 112 aa  138  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1494  hypothetical protein  62.96 
 
 		 112 aa  138  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.389909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5317  hypothetical protein  61.11 
 
 		 113 aa  134  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.552932 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5694  hypothetical protein  61.11 
 
 		 113 aa  134  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.533265 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2861  hypothetical protein  64.55 
 
 		 113 aa  134  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.81286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3680  hypothetical protein  61.11 
 
 		 113 aa  133  7.000000000000001e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.45633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0905  hypothetical protein  60.19 
 
 		 113 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2830  hypothetical protein  67.02 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.718699  normal  0.193212 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02038  beta-lactamase domain protein  45.05 
 
 		 454 aa  87.8  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2445  hypothetical protein  44.74 
 
 		 123 aa  87  7e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2150  hypothetical protein  42.2 
 
 		 116 aa  82  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.309277  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0726  hypothetical protein  35.14 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.785305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0224  hypothetical protein  39.36 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2914  hypothetical protein  38.53 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153507  normal  0.0550835 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0608  hypothetical protein  36.04 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2520  hypothetical protein  36.78 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2595  hypothetical protein  43.3 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.112687  normal  0.497297 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1213  hypothetical protein  43.3 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00326855  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4869  hypothetical protein  40.96 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4224  hypothetical protein  46.25 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2026  hypothetical protein  38.75 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.71052  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4369  hypothetical protein  73.17 
 
 		 51 aa  57.4  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2354  sterol desaturase-like protein  38.14 
 
 		 400 aa  53.5  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3211  hypothetical protein  37.5 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.400132  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1293  hypothetical protein  37.5 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>