25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1213 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1213  hypothetical protein  100 
 
 
139 aa  280  4.0000000000000003e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00326855  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2595  hypothetical protein  97.12 
 
 
139 aa  270  5.000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.112687  normal  0.497297 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2914  hypothetical protein  52.99 
 
 
128 aa  113  8.999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153507  normal  0.0550835 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2150  hypothetical protein  50.65 
 
 
116 aa  72.4  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.309277  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2445  hypothetical protein  51.95 
 
 
123 aa  71.6  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3900  hypothetical protein  42.11 
 
 
114 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.8573 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4984  hypothetical protein  41.76 
 
 
115 aa  60.5  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0726  hypothetical protein  33.33 
 
 
125 aa  59.3  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.785305  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4224  hypothetical protein  48.19 
 
 
111 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0224  hypothetical protein  38.16 
 
 
136 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02038  beta-lactamase domain protein  41.43 
 
 
454 aa  53.9  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3680  hypothetical protein  44.59 
 
 
113 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.45633  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5694  hypothetical protein  44.59 
 
 
113 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.533265 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5317  hypothetical protein  44.59 
 
 
113 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.552932 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1494  hypothetical protein  40.48 
 
 
112 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.389909  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4869  hypothetical protein  34.65 
 
 
278 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1470  hypothetical protein  40.48 
 
 
112 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2612  hypothetical protein  35.79 
 
 
115 aa  50.4  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3239  hypothetical protein  40.54 
 
 
114 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0905  hypothetical protein  46.15 
 
 
113 aa  47  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2861  hypothetical protein  35.71 
 
 
113 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.81286  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2520  hypothetical protein  33.33 
 
 
122 aa  46.2  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0608  hypothetical protein  31.33 
 
 
112 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2830  hypothetical protein  35 
 
 
150 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.718699  normal  0.193212 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2354  sterol desaturase-like protein  42.86 
 
 
400 aa  40.8  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>