15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3568 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3568  hypothetical protein  100 
 
 		 697 aa  1405    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.44867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7144  hypothetical protein  56.53 
 
 		 811 aa  406  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7811  hypothetical protein  44.01 
 
 		 817 aa  358  1.9999999999999998e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1930  hypothetical protein  39.39 
 
 		 852 aa  273  6e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.476426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3467  regulatory protein, LuxR  35.89 
 
 		 739 aa  244  3e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0929812 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1935  hypothetical protein  42.02 
 
 		 837 aa  244  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.273514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5697  hypothetical protein  30.73 
 
 		 802 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3551  hypothetical protein  33.25 
 
 		 670 aa  130  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0236032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6953  hypothetical protein  31 
 
 		 725 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.448128  normal  0.626872 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3596  hypothetical protein  33.21 
 
 		 1635 aa  122  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2518  hypothetical protein  33.21 
 
 		 1635 aa  122  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.189661  normal  0.373256 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4129  hypothetical protein  26.63 
 
 		 1675 aa  103  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.3835  normal  0.157034 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4075  hypothetical protein  27.5 
 
 		 634 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.130051 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1638  hypothetical protein  23.96 
 
 		 857 aa  69.7  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1889  WGR domain-containing protein  30.49 
 
 		 1086 aa  48.9  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00599399  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>