108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3405 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3405  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  325  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  normal  0.460418 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1820  hypothetical protein  55.56 
 
 
167 aa  190  7e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000101682  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1480  hypothetical protein  45.45 
 
 
158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1321  hypothetical protein  45.52 
 
 
174 aa  114  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.641608  normal  0.0856253 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4145  hypothetical protein  41.29 
 
 
202 aa  113  8.999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1364  hypothetical protein  45.86 
 
 
159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.951673  normal  0.623642 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1614  hypothetical protein  40 
 
 
152 aa  108  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.939726  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1332  hypothetical protein  40.65 
 
 
158 aa  105  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.223024  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0172  hypothetical protein  40.74 
 
 
155 aa  103  9e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6204  hypothetical protein  41.13 
 
 
164 aa  99  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474023  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1788  hypothetical protein  38.41 
 
 
161 aa  89  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2015  hypothetical protein  38.62 
 
 
168 aa  84.3  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.364404  n/a   
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5607  hypothetical protein  36.76 
 
 
176 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0623  hypothetical protein  41.28 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5225  hypothetical protein  38.24 
 
 
154 aa  82  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.653712 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2511  hypothetical protein  38.32 
 
 
134 aa  78.6  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00847737  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3084  hypothetical protein  39.81 
 
 
145 aa  78.2  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2498  hypothetical protein  36.69 
 
 
173 aa  78.2  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3144  hypothetical protein  39.81 
 
 
145 aa  78.2  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.193303  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3104  hypothetical protein  39.81 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.412887  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0749  hypothetical protein  37.59 
 
 
167 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.441888  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0763  hypothetical protein  37.59 
 
 
167 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127408  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0743  hypothetical protein  37.59 
 
 
167 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.163997  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5065  hypothetical protein  34.78 
 
 
150 aa  74.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.336664  normal  0.524632 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2738  hypothetical protein  32.61 
 
 
155 aa  74.7  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0877362  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2072  hypothetical protein  42.73 
 
 
157 aa  73.9  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.861634  normal  0.0346147 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4680  hypothetical protein  34.06 
 
 
150 aa  73.9  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4766  hypothetical protein  34.06 
 
 
150 aa  73.9  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.203772  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2085  hypothetical protein  37.16 
 
 
164 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.776425  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5388  hypothetical protein  33.94 
 
 
144 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11000  conserved hypothetical protein TIGR00026  36.7 
 
 
138 aa  72  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4989  hypothetical protein  35.4 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.794366  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0257  hypothetical protein  32.77 
 
 
147 aa  70.1  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0254  hypothetical protein  36.81 
 
 
157 aa  70.1  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2023  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.481727  normal  0.406652 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11590  hypothetical protein  36.61 
 
 
148 aa  68.6  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.30585e-85  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0512  hypothetical protein  35.88 
 
 
157 aa  68.6  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13580  hypothetical protein  30 
 
 
151 aa  68.2  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0664685 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4640  hypothetical protein  34.29 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4153  hypothetical protein  34.21 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0042  hypothetical protein  33.64 
 
 
159 aa  67.4  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.274125  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5261  hypothetical protein  33.33 
 
 
168 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1505  hypothetical protein  33.33 
 
 
166 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1126  hypothetical protein  36.67 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.726493  normal  0.303948 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2798  hypothetical protein  33.33 
 
 
140 aa  67  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00699009  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0052  hypothetical protein  32.73 
 
 
159 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0902572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0061  hypothetical protein  32.73 
 
 
159 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0484096 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0985  hypothetical protein  34.96 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0468293  normal  0.0249112 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4618  hypothetical protein  37.5 
 
 
164 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.168908  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3972  hypothetical protein  36.84 
 
 
169 aa  65.1  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.604025  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0266  hypothetical protein  37.74 
 
 
133 aa  64.3  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6160  hypothetical protein  30.91 
 
 
144 aa  63.9  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.237259  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0885  hypothetical protein  32.73 
 
 
151 aa  63.9  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2106  hypothetical protein  34.29 
 
 
177 aa  63.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.334754 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3761  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.88 
 
 
274 aa  63.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.80349  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5872  hypothetical protein  36.7 
 
 
144 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0817748 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2352  hypothetical protein  27.97 
 
 
150 aa  63.5  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.146044  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3827  hypothetical protein  33.33 
 
 
146 aa  62.8  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10710  conserved hypothetical protein TIGR00026  33.79 
 
 
360 aa  62.4  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.735464 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0997  hypothetical protein  35.58 
 
 
140 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2976  hypothetical protein  35.64 
 
 
163 aa  61.6  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000649339  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4457  hypothetical protein  31.67 
 
 
152 aa  61.6  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2616  hypothetical protein  35.24 
 
 
149 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3783  hypothetical protein  35.24 
 
 
150 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0482  hypothetical protein  33.06 
 
 
164 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1328  hypothetical protein  34.19 
 
 
153 aa  60.1  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2315  hypothetical protein  35.24 
 
 
142 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.121739  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2362  hypothetical protein  35.24 
 
 
142 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.579861  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2354  hypothetical protein  35.24 
 
 
142 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2498  hypothetical protein  35.51 
 
 
157 aa  58.9  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4642  hypothetical protein  32.73 
 
 
135 aa  58.9  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.543378  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4262  hypothetical protein  36.28 
 
 
146 aa  58.9  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.877042  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7866  hypothetical protein  36.11 
 
 
145 aa  58.9  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5840  hypothetical protein  32.69 
 
 
143 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.765788  normal  0.503571 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2456  hypothetical protein  35.4 
 
 
140 aa  57.4  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.597915  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4211  hypothetical protein  32.73 
 
 
135 aa  57.4  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2031  hypothetical protein  33.06 
 
 
125 aa  57  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0287759  normal  0.679852 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1829  hypothetical protein  33.11 
 
 
169 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0349871  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1876  hypothetical protein  33.11 
 
 
169 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0838475  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1810  hypothetical protein  33.11 
 
 
169 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0179461  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3969  hypothetical protein  30.17 
 
 
147 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.827845  normal  0.0645114 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2238  hypothetical protein  31.09 
 
 
152 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.477242  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2620  hypothetical protein  31.91 
 
 
148 aa  56.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00012961  normal  0.0164615 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3955  hypothetical protein  30.17 
 
 
147 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4029  hypothetical protein  30.17 
 
 
147 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412865  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13199  hypothetical protein  32.73 
 
 
119 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.190211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4541  hypothetical protein  35.19 
 
 
177 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.19385  normal  0.304332 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1007  hypothetical protein  34.91 
 
 
140 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.2875 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4634  Transcriptional regulators-like protein  31.9 
 
 
324 aa  54.7  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1187  hypothetical protein  34.26 
 
 
146 aa  54.3  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2630  hypothetical protein  35.24 
 
 
153 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.421408  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2675  hypothetical protein  35.24 
 
 
153 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.313846 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2659  hypothetical protein  35.24 
 
 
153 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.463167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1090  hypothetical protein  34.91 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.769148 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0978  hypothetical protein  31.86 
 
 
145 aa  51.2  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5424  hypothetical protein  33.33 
 
 
311 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.741222  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0833  hypothetical protein  29.63 
 
 
143 aa  48.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0055  hypothetical protein  39.71 
 
 
117 aa  47.8  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1126  hypothetical protein  31.19 
 
 
146 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.331179  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11287  hypothetical protein  26.95 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.91215  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>