58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1404 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1404  membrane protein-like protein  100 
 
 
331 aa  649    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1334  hypothetical protein  66.26 
 
 
330 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5230  hypothetical protein  70 
 
 
330 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.230023  normal  0.753806 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4951  hypothetical protein  70 
 
 
330 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4862  hypothetical protein  70 
 
 
330 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5458  hypothetical protein  66.67 
 
 
330 aa  429  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.812891 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13725  transmembrane protein  63.22 
 
 
330 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.258744  normal  0.61477 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4050  protein of unknown function DUF95 transmembrane  62.54 
 
 
331 aa  397  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2502  putative integral membrane protein  60.42 
 
 
331 aa  391  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3752  protein of unknown function DUF95 transmembrane  60.78 
 
 
334 aa  348  6e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3912  integral membrane protein  55.42 
 
 
331 aa  347  2e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00542014  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0756  hypothetical protein  53.57 
 
 
336 aa  340  2e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495478  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3829  protein of unknown function DUF95 transmembrane  52.99 
 
 
332 aa  329  3e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.157843  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2521  protein of unknown function DUF95 transmembrane  55.72 
 
 
329 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.626612  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4823  protein of unknown function DUF95 transmembrane  49.69 
 
 
331 aa  323  2e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5852  hypothetical protein  51.04 
 
 
336 aa  323  2e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.699479 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09270  uncharacterized membrane protein  50.62 
 
 
329 aa  305  6e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.130747 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1202  integral membrane protein  47.98 
 
 
328 aa  299  5e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.525523  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7600  protein of unknown function DUF95 transmembrane  47.85 
 
 
333 aa  296  4e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0773481  normal  0.0891448 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1272  protein of unknown function DUF95 transmembrane  46.88 
 
 
328 aa  294  1e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000243278 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2338  protein of unknown function DUF95 transmembrane  52.34 
 
 
329 aa  288  1e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00579329  hitchhiker  0.0000253307 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1613  hypothetical protein  47.83 
 
 
337 aa  285  1.0000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0233991 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1835  protein of unknown function DUF95 transmembrane  46.27 
 
 
328 aa  262  4.999999999999999e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.920974  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20720  uncharacterized membrane protein  44.44 
 
 
331 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.04898  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3801  hypothetical protein  27.87 
 
 
322 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4267  hypothetical protein  30.16 
 
 
335 aa  109  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000574123  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3215  protein of unknown function DUF95 transmembrane  27.88 
 
 
331 aa  103  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0604768  normal  0.220774 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3743  protein of unknown function DUF95 transmembrane  26.5 
 
 
332 aa  102  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.358562  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1082  hypothetical protein  26.73 
 
 
335 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2278  protein of unknown function DUF95 transmembrane  28.67 
 
 
320 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3128  protein of unknown function DUF95 transmembrane  29.22 
 
 
342 aa  100  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.423002 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4811  hypothetical protein  27.4 
 
 
321 aa  99  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00997057  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4440  integral membrane protein  24.38 
 
 
325 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.627062  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09283  hypothetical protein  21.82 
 
 
324 aa  84  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.481301  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3844  protein of unknown function DUF95 transmembrane  25.85 
 
 
330 aa  84  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0410  hypothetical protein  24.01 
 
 
342 aa  81.3  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.65934  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2967  hypothetical protein  28.05 
 
 
347 aa  79.7  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.597824  normal  0.0170262 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3317  hypothetical protein  25.37 
 
 
328 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.945777 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2676  hypothetical protein  32.09 
 
 
333 aa  77.4  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4022  integral membrane protein  26.51 
 
 
326 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.96338  normal  0.0627299 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4888  hypothetical protein  23.96 
 
 
326 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.32174  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56110  hypothetical protein  22.98 
 
 
326 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38340  hypothetical protein  24 
 
 
325 aa  73.9  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.5603  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0462  hypothetical protein  28.46 
 
 
356 aa  73.6  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.723266  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0233  protein of unknown function DUF95 transmembrane  21.55 
 
 
318 aa  64.7  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4959  protein of unknown function DUF95 transmembrane  22.15 
 
 
315 aa  65.1  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000637265 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2133  hypothetical protein  22.11 
 
 
603 aa  59.7  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4318  integral membrane protein  23.81 
 
 
326 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.416523  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2368  protein of unknown function DUF95 transmembrane  27.39 
 
 
211 aa  55.1  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2232  hypothetical protein  21 
 
 
324 aa  54.3  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0377235  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1683  protein of unknown function DUF95 transmembrane  23.22 
 
 
327 aa  53.1  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0289  integral membrane protein  31.15 
 
 
246 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.271645  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1789  protein of unknown function DUF95 transmembrane  26.21 
 
 
754 aa  46.2  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.482085 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0346  protein of unknown function DUF95 transmembrane  27.06 
 
 
528 aa  45.8  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.160239 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1854  protein of unknown function DUF95 transmembrane  37.5 
 
 
379 aa  44.3  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0524  hypothetical protein  23.33 
 
 
181 aa  43.9  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.202307  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3166  protein of unknown function DUF95 transmembrane  30.56 
 
 
509 aa  43.9  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1639  hypothetical protein  33.33 
 
 
193 aa  43.5  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>