29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0365 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0365  hypothetical protein  100 
 
 		 644 aa  1320    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0591662  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3083  FAD dependent oxidoreductase  42.77 
 
 		 650 aa  477  1e-133  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.620429  normal  0.485634 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1633  hypothetical protein  40.8 
 
 		 634 aa  466  9.999999999999999e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00578112  normal  0.776269 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3641  twin-arginine translocation pathway signal  38.79 
 
 		 636 aa  418  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16360  hypothetical protein  39.36 
 
 		 620 aa  398  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1422  hypothetical protein  39.06 
 
 		 620 aa  392  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1077  hypothetical protein  35.63 
 
 		 631 aa  381  1e-104  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.866744  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3728  hypothetical protein  35.76 
 
 		 621 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.154928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1454  twin-arginine translocation pathway signal  31.54 
 
 		 612 aa  261  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1600  twin-arginine translocation pathway signal  32.04 
 
 		 610 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.624014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4617  hypothetical protein  27.07 
 
 		 650 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.119323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0574  FAD dependent oxidoreductase  26.89 
 
 		 630 aa  164  4.0000000000000004e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186923  normal  0.385317 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1075  FAD dependent oxidoreductase  27.99 
 
 		 649 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0882552 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0651  putative flavin-containing monooxygenase  36.36 
 
 		 500 aa  48.5  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1683  FAD dependent oxidoreductase  40.74 
 
 		 513 aa  48.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3462  hypothetical protein  24.85 
 
 		 556 aa  47.8  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1890  protoporphyrinogen oxidase  35.8 
 
 		 454 aa  47  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1040  FAD dependent oxidoreductase  37.7 
 
 		 503 aa  46.6  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3423  FAD dependent oxidoreductase  30.83 
 
 		 400 aa  46.2  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0962  monooxygenase, flavin-binding family protein  43.9 
 
 		 491 aa  45.8  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.596228 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1565  FAD dependent oxidoreductase  43.9 
 
 		 510 aa  45.4  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1568  twin-arginine translocation pathway signal  30.23 
 
 		 536 aa  45.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1542  putative monooxygenase  40.43 
 
 		 502 aa  44.3  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.906051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2533  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.06 
 
 		 555 aa  44.7  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  47.5 
 
 		 409 aa  44.3  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2624  FAD dependent oxidoreductase  45.83 
 
 		 442 aa  44.3  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0433  FAD dependent oxidoreductase  41.18 
 
 		 516 aa  44.3  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.266425  hitchhiker  0.0000000915051 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0853  flavin-binding family monooxygenase  44.19 
 
 		 527 aa  44.3  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2444  K+ transport flavoprotein  42.86 
 
 		 524 aa  44.3  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>