25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0343 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0343  putative DNA-binding protein  100 
 
 		 109 aa  224  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2307  DNA-binding protein  65.71 
 
 		 109 aa  140  7e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4823  putative DNA-binding protein  60.55 
 
 		 115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0826  DNA-binding protein  65.31 
 
 		 107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3080  putative DNA-binding protein  58.18 
 
 		 110 aa  124  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.100633  normal  0.744122 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0642  putative DNA-binding protein  56.76 
 
 		 115 aa  123  9e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.141676 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0675  putative DNA-binding protein  57.27 
 
 		 115 aa  123  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.205405  decreased coverage  0.00947691 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0663  putative DNA-binding protein  57.27 
 
 		 115 aa  123  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.332778 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3435  DNA-binding protein  56.36 
 
 		 110 aa  120  5e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170412  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4600  DNA-binding protein  53.85 
 
 		 112 aa  120  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.889226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3371  hypothetical protein  60.91 
 
 		 143 aa  115  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0280865  normal  0.0203123 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1057  putative DNA-binding protein  53.15 
 
 		 119 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3144  hypothetical protein  61.26 
 
 		 143 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.185967  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0799  putative DNA-binding protein  49.54 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5076  putative DNA-binding protein  53 
 
 		 112 aa  100  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798385 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3796  putative DNA-binding protein  52.94 
 
 		 106 aa  100  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.691719 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05401  conserved hypothetical protein  46.15 
 
 		 117 aa  90.9  5e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.656737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0891  hypothetical protein  43.27 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27190  hypothetical protein  38.32 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.133249  normal  0.930343 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4567  hypothetical protein  42.72 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2157  hypothetical protein  35.24 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2310  hypothetical protein  34.29 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521659 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0719  hypothetical protein  37.25 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0906401  normal  0.324019 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0739  hypothetical protein  37.74 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.13396 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0725  hypothetical protein  37.74 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.609252  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>