12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0217 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0217  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  411  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2112  transposase Tn3 family protein  49.55 
 
 		 988 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5222  transposase Tn3 family protein  50.44 
 
 		 412 aa  112  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5067  transposase Tn3 family protein  44.64 
 
 		 969 aa  109  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0388929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3698  transposase Tn3 family protein  47.75 
 
 		 974 aa  107  9.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0861191  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1095  putative transposase  47.32 
 
 		 332 aa  105  5e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0110923 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3695  transposase Tn3 family protein  43.75 
 
 		 969 aa  105  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3661  transposase Tn3 family protein  47.32 
 
 		 950 aa  101  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2367  transposase Tn3  43.97 
 
 		 815 aa  101  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3614  transposase Tn3 family protein  45.45 
 
 		 1009 aa  95.5  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5123  transposase  44.71 
 
 		 89 aa  84.7  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2047  transposase  23.68 
 
 		 217 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>