33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3810 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3810  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  257  4e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4317  hypothetical protein  58.47 
 
 		 123 aa  150  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2896  hypothetical protein  43.24 
 
 		 124 aa  106  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3485  hypothetical protein  36.59 
 
 		 137 aa  94.7  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0944759 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00943  hypothetical protein  42.35 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7074  hypothetical protein  28.04 
 
 		 173 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00681904  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26270  hypothetical protein  25.26 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04778  hypothetical protein  33.72 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2369  hypothetical protein  26.21 
 
 		 174 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.38542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1660  hypothetical protein  28.97 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.149614  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0207  hypothetical protein  22.34 
 
 		 125 aa  45.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.335071  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5937  hypothetical protein  23.36 
 
 		 174 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.805677  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4398  hypothetical protein  25.26 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0862516 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2908  hypothetical protein  28.04 
 
 		 129 aa  45.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0905  hypothetical protein  22.22 
 
 		 222 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3684  hypothetical protein  22.52 
 
 		 139 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.439114  normal  0.115226 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2470  hypothetical protein  22.22 
 
 		 139 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0716803  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2609  hypothetical protein  22.22 
 
 		 139 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3843  hypothetical protein  22.52 
 
 		 139 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4521  hypothetical protein  22.52 
 
 		 139 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1570  hypothetical protein  34.55 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2932  hypothetical protein  25 
 
 		 175 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.784361  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4901  hypothetical protein  21.62 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0916616  hitchhiker  0.000097555 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0556  hypothetical protein  22.22 
 
 		 307 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.115578  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1420  hypothetical protein  34.55 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0458  hypothetical protein  29.23 
 
 		 138 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2111  hypothetical protein  29.23 
 
 		 138 aa  41.2  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3800  hypothetical protein  25 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.92452  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2253  hypothetical protein  24.21 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0821742  normal  0.0981277 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0436  hypothetical protein  25 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.888364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3065  hypothetical protein  22.12 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.367568  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5566  hypothetical protein  24.21 
 
 		 139 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.869642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3740  hypothetical protein  24.21 
 
 		 139 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.298391  normal  0.20234 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>