17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2915 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2915  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 152 aa  308  1e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0339  putative transcriptional regulator  52.05 
 
 		 159 aa  141  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3692  putative transcriptional regulator  47.65 
 
 		 152 aa  134  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.376919 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0871  transcriptional regulator, XRE family  52.13 
 
 		 170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.56743  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0884  DNA-binding transcriptional regulator  54.76 
 
 		 187 aa  100  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.334392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0424  hypothetical protein  50 
 
 		 210 aa  98.6  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0590756  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3169  Cro/CI family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 126 aa  84.3  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0259  XRE family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 102 aa  57  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000494587  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2518  transcriptional regulator, XRE family  36.76 
 
 		 101 aa  50.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000496163  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5380  hypothetical protein  37.31 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5481  hypothetical protein  37.31 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.143016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0571  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 107 aa  45.1  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31070  DNA-binding protein  33.78 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.354613  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4821  hypothetical protein  35.82 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1291  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3452  XRE family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.663331  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2319  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.48 
 
 		 72 aa  40.4  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>