20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1618 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1618  hypothetical protein  100 
 
 		 268 aa  557  1e-158  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1807  hypothetical protein  65.4 
 
 		 276 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2471  hypothetical protein  64.55 
 
 		 281 aa  354  6.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.519475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1815  hypothetical protein  65.02 
 
 		 276 aa  352  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1854  hypothetical protein  64.18 
 
 		 281 aa  352  5e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.549839  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1839  hypothetical protein  66.95 
 
 		 275 aa  338  7e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2113  hypothetical protein  50.19 
 
 		 265 aa  275  4e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.018771  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1473  hypothetical protein  37.26 
 
 		 268 aa  192  6e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3565  extracellular solute-binding protein  38.26 
 
 		 252 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1833  hypothetical protein  37.56 
 
 		 279 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.432848 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2687  hypothetical protein  34.9 
 
 		 261 aa  172  5e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0951528  normal  0.504159 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1622  extracellular solute-binding protein  36.21 
 
 		 266 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.12881 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3943  periplasmic binding protein  36.96 
 
 		 277 aa  170  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3812  extracellular solute-binding protein  35.34 
 
 		 266 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4246  periplasmic binding protein  35.34 
 
 		 266 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2024  hypothetical protein  36.41 
 
 		 279 aa  168  9e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.20438  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2686  extracellular solute-binding protein  33.85 
 
 		 263 aa  159  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0129689  normal  0.492762 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1878  amino acid ABC transporter periplasmic protein  29.33 
 
 		 246 aa  136  4e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.201916  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1864  Hpt sensor hybrid histidine kinase  25.57 
 
 		 1069 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0404414  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2232  hypothetical protein  25.41 
 
 		 243 aa  47.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>