11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3067 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3067  putative transposase  100 
 
 		 46 aa  95.5  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2032  IS605 family transposase  75 
 
 		 166 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2023  IS605 family transposase  69.57 
 
 		 315 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292395  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3631  transposase family protein  69.57 
 
 		 175 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000970076  normal  0.460332 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1279  transposase IS200-family protein  58.54 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0666  transposase  54.55 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00248601  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1391  transposase  52.27 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.01496  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5522  IS element transposase  47.5 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1500  transposase IS200  53.85 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.864128  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3237  IS200 transposase orfA  51.52 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.282836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1392  transposase IS200-family protein  45.95 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000879011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>