More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0733 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0733  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  100 
 
 
97 aa  198  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.527542  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3814  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  76.04 
 
 
97 aa  158  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3625  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  74.74 
 
 
103 aa  154  6e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0619  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  72.45 
 
 
98 aa  152  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.571883  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0580  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  70.1 
 
 
97 aa  147  5e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0286747  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03554  acetolactate synthase small subunit  71.59 
 
 
96 aa  138  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0033  acetolactate synthase, small subunit  71.59 
 
 
96 aa  138  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0029  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  71.59 
 
 
96 aa  138  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4037  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  71.59 
 
 
96 aa  138  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.662248 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4179  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  71.59 
 
 
96 aa  138  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3075  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  64.42 
 
 
104 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5103  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  71.59 
 
 
96 aa  138  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.094181 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3883  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  71.59 
 
 
96 aa  138  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03496  hypothetical protein  71.59 
 
 
96 aa  138  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4249  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  70.45 
 
 
96 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4184  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  71.59 
 
 
96 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4021  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  71.59 
 
 
96 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4076  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  71.59 
 
 
96 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4005  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  71.59 
 
 
96 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4126  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  71.59 
 
 
96 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0026  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  65.98 
 
 
95 aa  134  4e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.999371 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1949  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  71.76 
 
 
115 aa  132  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.422886  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1838  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  71.76 
 
 
115 aa  132  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2288  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  71.76 
 
 
115 aa  132  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1619  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  65.17 
 
 
103 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.675263 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0399  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  67.06 
 
 
121 aa  120  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1882  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  65.88 
 
 
121 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2623  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  64.29 
 
 
115 aa  110  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1630  acetolactate synthase, small subunit  58.62 
 
 
96 aa  110  6e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.582859  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0157  amino acid-binding ACT domain-containing protein  59.26 
 
 
130 aa  99.4  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0012  acetolactate synthase, small subunit  46.48 
 
 
167 aa  63.5  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.046385  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1989  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.48 
 
 
176 aa  60.8  0.000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.609838  normal  0.244787 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0503  acetolactate synthase, small subunit  42.25 
 
 
170 aa  60.8  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.723319  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3237  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40 
 
 
165 aa  60.1  0.000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.761628  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3616  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40.58 
 
 
164 aa  59.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000178252  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08840  acetolactate synthase, small subunit  36.14 
 
 
162 aa  58.9  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.20928  normal  0.22405 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7781  acetolactate synthase, small subunit  44.93 
 
 
207 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.460716 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0899  acetolactate synthase, small subunit  41.43 
 
 
167 aa  58.5  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1444  acetolactate synthase, small subunit  37.65 
 
 
167 aa  58.2  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.336176  hitchhiker  0.00470003 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1876  acetolactate synthase, small subunit  37.21 
 
 
161 aa  57.4  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000339514 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08471  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.03 
 
 
176 aa  57.8  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2019  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  34.94 
 
 
164 aa  57.4  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.128941  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2278  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  36.14 
 
 
164 aa  56.2  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1954  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  36.84 
 
 
164 aa  55.5  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0934233 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08880  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  39.13 
 
 
168 aa  55.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0671  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.03 
 
 
176 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0328623  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1775  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  36.14 
 
 
164 aa  55.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1096  acetolactate synthase small subunit  39.19 
 
 
172 aa  55.5  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.751522  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2667  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.67 
 
 
164 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000176129  decreased coverage  0.000698491 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2123  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  36 
 
 
164 aa  55.5  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.343992  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1749  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  34.94 
 
 
164 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.306169  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1829  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  34.94 
 
 
164 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001648  acetolactate synthase small subunit  35.71 
 
 
164 aa  55.1  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00890505  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2270  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  34.94 
 
 
164 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.493078  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2517  acetolactate synthase, small subunit  35.37 
 
 
170 aa  55.1  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000223689  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1091  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40.58 
 
 
174 aa  55.1  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00826  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  36.9 
 
 
164 aa  54.7  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3021  acetolactate synthase, small subunit  32.91 
 
 
166 aa  54.7  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000136695  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0591  acetolactate synthase, small subunit  37.8 
 
 
166 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000221035  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00557  acetolactate synthase III, small subunit  32.53 
 
 
165 aa  54.3  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2434  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  39.19 
 
 
172 aa  54.7  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.312888  normal  0.272193 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3579  acetolactate synthase, small subunit  42.25 
 
 
185 aa  54.3  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00517433  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2896  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40.58 
 
 
171 aa  54.3  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.386622  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0694  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  36 
 
 
164 aa  54.3  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2543  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  31.33 
 
 
163 aa  54.3  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000667629  hitchhiker  0.0000555489 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0719  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  39.19 
 
 
172 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0282  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  36.23 
 
 
170 aa  53.9  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1910  acetolactate synthase, small subunit  35.53 
 
 
164 aa  54.3  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.115995  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3745  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.48 
 
 
172 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000214698  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2120  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  35.71 
 
 
163 aa  53.9  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.596226  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2139  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  32.53 
 
 
164 aa  53.9  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.141993  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2768  acetolactate synthase, small subunit  36.99 
 
 
221 aa  53.9  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0904  acetolactate synthase, small subunit  35.44 
 
 
242 aa  53.5  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.96493  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3431  acetolactate synthase, small subunit  36.9 
 
 
166 aa  53.5  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.418353  normal  0.014642 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0219  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40.58 
 
 
161 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.680597  normal  0.0364419 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2257  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  31.71 
 
 
172 aa  52.8  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13461  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  39.13 
 
 
174 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0625  acetolactate synthase, small subunit  39.44 
 
 
165 aa  52.8  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1627  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  32.91 
 
 
164 aa  53.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.800745  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0224  acetolactate synthase, small subunit  35.71 
 
 
164 aa  52.8  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.708645  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12301  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  39.13 
 
 
176 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0783462 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13311  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  39.13 
 
 
174 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.477847  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3652  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  39.13 
 
 
172 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000715125  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1709  acetolactate synthase, small subunit  37.68 
 
 
175 aa  52.4  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.529781 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1990  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  34.29 
 
 
165 aa  52.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2035  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  37.84 
 
 
182 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.403996 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2457  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  39.13 
 
 
172 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1972  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  34.94 
 
 
164 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0607984  hitchhiker  0.0000404141 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18800  acetolactate synthase, small subunit  39.13 
 
 
171 aa  52.4  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.425298  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1253  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  39.13 
 
 
174 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.28788  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2375  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  34.94 
 
 
164 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0991612  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2491  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  34.94 
 
 
164 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126247  hitchhiker  0.000727987 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1901  acetolactate synthase, small subunit  36.62 
 
 
166 aa  52.8  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0148095  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2058  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  37.33 
 
 
164 aa  52.4  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0111  acetolactate synthase, small subunit  36.62 
 
 
165 aa  52.4  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.849988  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1164  acetolactate synthase, small subunit  40.58 
 
 
174 aa  52.4  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.686831  normal  0.036198 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1188  acetolactate synthase, small subunit  37.68 
 
 
161 aa  52  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2387  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  34.94 
 
 
164 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0474277  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13211  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  37.68 
 
 
174 aa  52  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.463823  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2519  acetolactate synthase small subunit  31.33 
 
 
164 aa  52  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>