21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3685 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3685  NERD domain-containing protein  100 
 
 		 353 aa  738    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3845  NERD domain-containing protein  62.89 
 
 		 329 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000986897 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0647  NERD domain-containing protein  62.89 
 
 		 329 aa  457  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016807  hitchhiker  0.00000125306 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3374  NERD domain-containing protein  62.89 
 
 		 329 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000216973  decreased coverage  0.000336538 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0675  NERD domain-containing protein  60.91 
 
 		 329 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.160777  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0648  NERD domain-containing protein  60.91 
 
 		 329 aa  450  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.188576  normal  0.0135957 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3657  NERD domain-containing protein  60.5 
 
 		 351 aa  436  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.779126  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3961  NERD domain-containing protein  36.06 
 
 		 310 aa  204  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0609224  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0336  hypothetical protein  41.26 
 
 		 234 aa  177  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1003  NERD domain-containing protein  27.73 
 
 		 344 aa  92  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0664  HRDC domain-containing protein  25.44 
 
 		 361 aa  57  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0121317  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0665  HRDC domain-containing protein  24.85 
 
 		 361 aa  55.8  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.126203  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3205  NERD domain protein  29.81 
 
 		 304 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.474591  normal  0.680793 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0218  NERD domain protein  25.88 
 
 		 310 aa  55.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0334  NERD domain-containing protein  24.37 
 
 		 225 aa  49.7  0.00007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0988306  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1607  NERD domain protein  31.58 
 
 		 211 aa  45.4  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1416  NERD domain-containing protein  25.93 
 
 		 225 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2522  DNA-binding NERD domain-containing protein  31.25 
 
 		 269 aa  44.3  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0442  NERD domain protein  36.11 
 
 		 261 aa  43.5  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1615  hypothetical protein  37.97 
 
 		 329 aa  43.1  0.007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.269609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0503  NERD domain-containing protein  28.57 
 
 		 224 aa  42.7  0.009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.180514  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>