More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2794 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01255  6-phosphogluconate dehydrogenase  60.89 
 
 
517 aa  659    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.602496  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2341  6-phosphogluconate dehydrogenase  63.1 
 
 
510 aa  669    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.673098  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1902  6-phosphogluconate dehydrogenase  76.22 
 
 
508 aa  806    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2794  6-phosphogluconate dehydrogenase  100 
 
 
511 aa  1052    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000310387  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1461  6-phosphogluconate dehydrogenase  76.97 
 
 
517 aa  815    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233963 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3220  6-phosphogluconate dehydrogenase  78.39 
 
 
517 aa  827    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0151158 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1723  6-phosphogluconate dehydrogenase  77.58 
 
 
508 aa  827    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2969  6-phosphogluconate dehydrogenase  77.58 
 
 
508 aa  826    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.727266  normal  0.666571 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2842  6-phosphogluconate dehydrogenase  77.58 
 
 
508 aa  827    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1935  6-phosphogluconate dehydrogenase  71.21 
 
 
521 aa  760    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1534  6-phosphogluconate dehydrogenase  77.58 
 
 
508 aa  826    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.976623  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1609  6-phosphogluconate dehydrogenase  75.83 
 
 
508 aa  803    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1684  6-phosphogluconate dehydrogenase  76.02 
 
 
508 aa  804    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2724  6-phosphogluconate dehydrogenase  74.8 
 
 
509 aa  791    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1677  6-phosphogluconate dehydrogenase  75.83 
 
 
508 aa  802    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2824  6-phosphogluconate dehydrogenase  77.58 
 
 
508 aa  826    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2561  6-phosphogluconate dehydrogenase  77.36 
 
 
513 aa  817    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1365  6-phosphogluconate dehydrogenase  72.17 
 
 
511 aa  755    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3505  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  58.7 
 
 
507 aa  611  9.999999999999999e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2937  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  51.31 
 
 
500 aa  533  1e-150  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.350304 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1950  6-phosphogluconate dehydrogenase  51.52 
 
 
505 aa  498  1e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0758  6-phosphogluconate dehydrogenase  51.01 
 
 
501 aa  496  1e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2599  6-phosphogluconate dehydrogenase  51.1 
 
 
523 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1694  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  49 
 
 
474 aa  473  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2279  6-phosphogluconate dehydrogenase  48.38 
 
 
471 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000283239  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1061  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  46.48 
 
 
477 aa  452  1.0000000000000001e-126  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.142467  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0326  6-phosphogluconate dehydrogenase  47.57 
 
 
469 aa  451  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2404  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.39 
 
 
484 aa  449  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0833  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  45.47 
 
 
490 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0420  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.59 
 
 
471 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0469  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.59 
 
 
471 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0828  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.59 
 
 
471 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.742561  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2376  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.59 
 
 
471 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1215  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.17 
 
 
482 aa  439  9.999999999999999e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000332109  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0631  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.39 
 
 
471 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.410653  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1798  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.59 
 
 
471 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2515  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.59 
 
 
471 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.864381  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2625  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  46.34 
 
 
483 aa  435  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0925  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.29 
 
 
480 aa  436  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4083  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  44.58 
 
 
484 aa  436  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642645  normal  0.213475 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2210  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.78 
 
 
469 aa  436  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.828318  normal  0.666462 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1948  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.82 
 
 
481 aa  433  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0180  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  44.49 
 
 
484 aa  434  1e-120  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2811  6-phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating)  45.14 
 
 
482 aa  432  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4715  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.45 
 
 
469 aa  432  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.246176  decreased coverage  0.00597476 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03954  hypothetical protein similar to 6-phosphogluconate dehydrogenase (Eurofung)  46.75 
 
 
490 aa  431  1e-119  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0543109 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2847  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.15 
 
 
468 aa  431  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1244  6-phosphogluconate dehydrogenase  44.4 
 
 
484 aa  430  1e-119  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2181  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.87 
 
 
470 aa  430  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.296225  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3620  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.87 
 
 
470 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4459  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.87 
 
 
470 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2110  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.08 
 
 
489 aa  431  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0642  6-phosphogluconate dehydrogenase  44.85 
 
 
472 aa  430  1e-119  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000463294  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1204  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.75 
 
 
468 aa  430  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3907  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.87 
 
 
470 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2297  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  45.66 
 
 
490 aa  430  1e-119  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.799207  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3801  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.46 
 
 
470 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.835565 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0635  6-phosphogluconate dehydrogenase  44.69 
 
 
484 aa  427  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4676  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.87 
 
 
470 aa  427  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0753605  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0340  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  42.74 
 
 
485 aa  426  1e-118  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.101232  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3285  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.67 
 
 
470 aa  428  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5973  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.78 
 
 
469 aa  422  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.91163  normal  0.882355 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1320  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.55 
 
 
468 aa  422  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0119731  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0397  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  45.07 
 
 
468 aa  425  1e-117  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3598  6-phosphogluconate dehydrogenase  43 
 
 
486 aa  423  1e-117  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3959  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.51 
 
 
476 aa  423  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.111769 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11872  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.14 
 
 
483 aa  420  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000287104  normal  0.308881 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4562  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  43.74 
 
 
487 aa  419  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69500  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.04 
 
 
508 aa  421  1e-116  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.239936  normal  0.16474 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0892  6-phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating)  42.05 
 
 
477 aa  421  1e-116  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.305911  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1608  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.55 
 
 
468 aa  419  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.222702 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0924  6-phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating)  43.75 
 
 
475 aa  419  1e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.273894  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2762  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  45.42 
 
 
485 aa  419  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.370116  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2102  6-phosphogluconate dehydrogenase  43.68 
 
 
479 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.572478  normal  0.157506 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0166  6-phosphogluconate dehydrogenase  44.33 
 
 
469 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0159  6-phosphogluconate dehydrogenase  44.33 
 
 
469 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0157  6-phosphogluconate dehydrogenase  44.33 
 
 
469 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01050  phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating), putative  45.22 
 
 
491 aa  416  9.999999999999999e-116  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3359  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.04 
 
 
484 aa  418  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.191261  normal  0.983915 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0186  6-phosphogluconate dehydrogenase  44.33 
 
 
469 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0164  6-phosphogluconate dehydrogenase  44.33 
 
 
469 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3089  6-phosphogluconate dehydrogenase  44.75 
 
 
489 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.609606 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0208  6-phosphogluconate dehydrogenase  44.33 
 
 
469 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3014  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.34 
 
 
468 aa  417  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000146076  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07950  6-phosphogluconate dehydrogenase  42.54 
 
 
486 aa  417  9.999999999999999e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.367535  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2449  6-phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating)  44.84 
 
 
478 aa  416  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0685  6-phosphogluconate dehydrogenase  44.87 
 
 
482 aa  418  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2206  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.34 
 
 
468 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.553067  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2309  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.34 
 
 
468 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00877145 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0111  6-phosphogluconate dehydrogenase  43.84 
 
 
469 aa  412  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0293528  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3297  6-phosphogluconate dehydrogenase  43.8 
 
 
475 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2260  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.34 
 
 
468 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00724007 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2420  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.34 
 
 
468 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.511918  hitchhiker  0.0040278 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2307  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.34 
 
 
468 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.97354  hitchhiker  0.00484467 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4789  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  43.51 
 
 
486 aa  412  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0101  6-phosphogluconate dehydrogenase  43.84 
 
 
469 aa  412  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2642  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.38 
 
 
468 aa  413  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5683  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  44.11 
 
 
479 aa  413  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.696376  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36670  6-phosphogluconate dehydrogenase  43.03 
 
 
484 aa  409  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26583  normal  0.322334 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1031  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.34 
 
 
468 aa  411  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.715181 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>