20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2303 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_2083  hypothetical protein  73.58 
 
 
615 aa  955    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.999521  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2303  hypothetical protein  100 
 
 
678 aa  1403    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00124  hypothetical protein  58.65 
 
 
622 aa  740    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1188  hypothetical protein  35.41 
 
 
1022 aa  413  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0183  hypothetical protein  35.38 
 
 
853 aa  412  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0347623 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0313  hypothetical protein  34.26 
 
 
746 aa  373  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2116  hypothetical protein  40.48 
 
 
507 aa  361  3e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.539609  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0636  hypothetical protein  33.49 
 
 
759 aa  347  5e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0115625 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0987  hypothetical protein  33.59 
 
 
664 aa  346  8.999999999999999e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1016  hypothetical protein  33.44 
 
 
664 aa  344  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.244285  normal  0.98373 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1219  hypothetical protein  33.18 
 
 
693 aa  340  7e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1399  hypothetical protein  33.26 
 
 
487 aa  256  1.0000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.283168  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0168  hypothetical protein  30.36 
 
 
483 aa  201  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2115  Peptidase M15A  46.85 
 
 
358 aa  107  6e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.759128  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4496  hypothetical protein  32.18 
 
 
209 aa  69.7  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.115903 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0344  histidine triad (HIT) protein  35.11 
 
 
268 aa  62.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.448559 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0840  histidine triad (HIT) protein  32.67 
 
 
266 aa  59.7  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  hitchhiker  0.000000646753 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4113  histidine triad (HIT) protein  39.74 
 
 
289 aa  59.7  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.489073 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0398  histidine triad (HIT) protein  39.74 
 
 
284 aa  58.2  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4049  histidine triad (HIT) protein  35 
 
 
289 aa  54.7  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318812  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>