13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2174 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2174  nuclear transport factor 2  100 
 
 		 123 aa  250  5.000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3954  nuclear transport factor 2  42.59 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199475  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3295  nuclear transport factor 2  37.17 
 
 		 122 aa  84.3  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.168461 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4664  nuclear transport factor 2  34.48 
 
 		 123 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.863106 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4370  nuclear transport factor 2  34.78 
 
 		 119 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0442394  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4139  nuclear transport factor 2  33.91 
 
 		 119 aa  77  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478479  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4214  nuclear transport factor 2  33.91 
 
 		 119 aa  77  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1514  steroid delta-isomerase  31.71 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3765  nuclear transport factor 2  35.4 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.581539  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2053  nuclear transport factor 2  32.76 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.153655 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4817  steroid delta-isomerase  33.33 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3596  nuclear transport factor 2  25.66 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.442215  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4985  steroid delta-5-3-ketosteroid isomerase  25.83 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>