18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2059 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_2059  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  335  1.9999999999999998e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1038  hypothetical protein  64.15 
 
 
160 aa  232  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3360  hypothetical protein  51.88 
 
 
158 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4365  hypothetical protein  48.08 
 
 
165 aa  157  8e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2632  hypothetical protein  43.95 
 
 
161 aa  153  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0218176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1270  hypothetical protein  43.95 
 
 
161 aa  149  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4437  hypothetical protein  51.8 
 
 
135 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0572  hypothetical protein  43.83 
 
 
172 aa  137  7.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1498  hypothetical protein  40.24 
 
 
162 aa  134  5e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0611051  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3577  hypothetical protein  35.67 
 
 
162 aa  90.5  9e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4230  hypothetical protein  35.67 
 
 
162 aa  90.5  9e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4258  hypothetical protein  36.03 
 
 
196 aa  85.1  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.621296  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0052  hypothetical protein  35.54 
 
 
156 aa  80.9  0.000000000000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5433  hypothetical protein  32.84 
 
 
216 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2917  hypothetical protein  27.12 
 
 
199 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0374  hypothetical protein  30.97 
 
 
146 aa  52.8  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1131  hypothetical protein  31.63 
 
 
178 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5591  Domain of unknown function DUF1863  28 
 
 
165 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>