18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4901 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4901  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  375  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269123  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4794  hypothetical protein  51.98 
 
 
202 aa  157  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1331  hypothetical protein  53.37 
 
 
209 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3220  hypothetical protein  48.86 
 
 
206 aa  134  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0851  hypothetical protein  56.96 
 
 
201 aa  133  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00740746 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3116  hypothetical protein  52.78 
 
 
197 aa  132  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0221368  normal  0.131971 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03040  hypothetical protein  48.43 
 
 
194 aa  125  6e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1574  hypothetical protein  49.45 
 
 
204 aa  118  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.60477  hitchhiker  0.00480214 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13040  hypothetical protein  44.83 
 
 
255 aa  114  6.9999999999999995e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3225  hypothetical protein  49.02 
 
 
227 aa  108  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2550  hypothetical protein  36.32 
 
 
194 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.70091  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1905  hypothetical protein  41.04 
 
 
190 aa  85.1  6e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3208  hypothetical protein  49.4 
 
 
199 aa  82  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.642161  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2817  hypothetical protein  24.57 
 
 
222 aa  67.4  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.508332  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3874  hypothetical protein  23.13 
 
 
188 aa  50.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.912957  normal  0.123813 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1491  hypothetical protein  26.71 
 
 
212 aa  50.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00278344  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07661  hypothetical protein  30.28 
 
 
229 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.411925  hitchhiker  0.00185927 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0375  hypothetical protein  30.68 
 
 
231 aa  42.4  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>