22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4699 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4699  Gas vesicle K  100 
 
 
101 aa  194  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2382  gas vesicle K  67.39 
 
 
96 aa  120  9e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.393686 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2388  gas vesicle K  67.39 
 
 
96 aa  120  9e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265897  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2341  gas vesicle K  67.39 
 
 
96 aa  120  9e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2348  Gas vesicle K  69.23 
 
 
157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.367322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6862  hypothetical protein  69.32 
 
 
113 aa  114  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.305883  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3389  gas vesicle K  65.59 
 
 
96 aa  108  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.209261  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2406  gas vesicle K  53.93 
 
 
120 aa  101  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.664539  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0706  hypothetical protein  56.04 
 
 
116 aa  100  5e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1801  Gas vesicle K  53.19 
 
 
114 aa  98.6  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3257  gas vesicle K  54.22 
 
 
110 aa  85.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.224981 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3575  putative gas vesicle synthesis protein  54.22 
 
 
110 aa  85.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1261  gas vesicle protein K  54.76 
 
 
110 aa  81.3  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.16105  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2332  gas vesicle K  42.55 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00031127 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0074  gas vesicle protein GVPa  46.34 
 
 
157 aa  68.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112832  decreased coverage  0.000485271 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2827  hypothetical protein  36.76 
 
 
96 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0340  Gas vesicle K  43.04 
 
 
114 aa  54.3  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1487  gas vesicle K  36 
 
 
105 aa  51.2  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.48089  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4009  gas vesicle K  43.18 
 
 
135 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.910553 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0072  gas vesicle K  35.29 
 
 
104 aa  44.3  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.349915  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0337  hypothetical protein  38.46 
 
 
123 aa  44.3  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.912911 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2368  Gas vesicle K  40.32 
 
 
114 aa  41.6  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>