31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1645 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1645  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  253  7e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.54562  normal  0.619548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3668  hypothetical protein  46.72 
 
 
156 aa  106  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2389  DnaJ-like protein  43.2 
 
 
128 aa  93.2  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.311805  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1984  hypothetical protein  46.43 
 
 
140 aa  92  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0260161  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4391  hypothetical protein  42.86 
 
 
188 aa  90.5  7e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.579425  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0960  hypothetical protein  42.74 
 
 
159 aa  87.8  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0614647  decreased coverage  0.00444563 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2069  hypothetical protein  45.37 
 
 
140 aa  88.2  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1965  hypothetical protein  43.09 
 
 
141 aa  78.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.390139  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2182  hypothetical protein  35.77 
 
 
133 aa  77.4  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3249  hypothetical protein  34.71 
 
 
197 aa  72.8  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3536  hypothetical protein  35.9 
 
 
201 aa  71.6  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4761  hypothetical protein  33.86 
 
 
136 aa  69.7  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0120  DnaJ-like, subfamily C, member 28, conserved domain protein  34.68 
 
 
162 aa  65.5  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.187684  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06200  protein of unknown function (DUF1992)  39.13 
 
 
162 aa  63.5  0.0000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05050  protein of unknown function (DUF1992)  36.29 
 
 
200 aa  62.8  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2138  hypothetical protein  35.48 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2022  hypothetical protein  32.26 
 
 
124 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000128299  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0033  hypothetical protein  35.78 
 
 
126 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2043  hypothetical protein  35.56 
 
 
134 aa  47  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0357  hypothetical protein  35.42 
 
 
129 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1425  hypothetical protein  46.15 
 
 
127 aa  45.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1391  DnaJ-like, subfamily C, member 28  31.11 
 
 
132 aa  44.7  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0545891  normal  0.728464 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1180  hypothetical protein  40 
 
 
138 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2597  hypothetical protein  28.57 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000533442 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0374  hypothetical protein  29.35 
 
 
123 aa  42  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0531  hypothetical protein  32.93 
 
 
137 aa  42  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0621  hypothetical protein  35.62 
 
 
123 aa  41.2  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2450  hypothetical protein  27.55 
 
 
135 aa  41.2  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.324613  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2712  hypothetical protein  27.27 
 
 
287 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1375  hypothetical protein  33.82 
 
 
124 aa  40.8  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0308072  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1157  hypothetical protein  35.56 
 
 
132 aa  40.4  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>