16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0876 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0876  hypothetical protein  100 
 
 
173 aa  350  5e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.421215  normal  0.502817 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1488  hypothetical protein  50.58 
 
 
179 aa  147  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6003  hypothetical protein  29.65 
 
 
173 aa  68.9  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0110653  normal  0.045581 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2138  hypothetical protein  32.02 
 
 
182 aa  64.7  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.239133  normal  0.309943 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4195  hypothetical protein  27.59 
 
 
181 aa  58.5  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225203  normal  0.0111128 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2020  hypothetical protein  25.86 
 
 
168 aa  58.2  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0565565 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4911  hypothetical protein  27.59 
 
 
176 aa  57.8  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92609  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4319  hypothetical protein  25 
 
 
174 aa  54.3  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.535003 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2157  hypothetical protein  29.09 
 
 
191 aa  53.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1391  hypothetical protein  27.65 
 
 
167 aa  52  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5771  hypothetical protein  22.81 
 
 
171 aa  47.8  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.654836  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3077  hypothetical protein  40 
 
 
177 aa  47  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0108  hypothetical protein  25.15 
 
 
167 aa  45.1  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3028  hypothetical protein  28.1 
 
 
185 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.514475  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0068  hypothetical protein  33.33 
 
 
175 aa  41.2  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.90321 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5363  hypothetical protein  28.48 
 
 
181 aa  40.8  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>