25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6297 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_6297  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  328  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0291  hypothetical protein  54.34 
 
 		 174 aa  181  4.0000000000000006e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0267  hypothetical protein  54.34 
 
 		 174 aa  181  4.0000000000000006e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.708651  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3117  hypothetical protein  51.19 
 
 		 169 aa  177  4.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4327  hypothetical protein  45.86 
 
 		 185 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.457545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4477  hypothetical protein  44.7 
 
 		 181 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.320227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1002  hypothetical protein  44.88 
 
 		 181 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4780  hypothetical protein  43.75 
 
 		 180 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.472606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3004  putative lipid carrier protein-like protein  42.4 
 
 		 179 aa  89  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.195226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0466  hypothetical protein  39.34 
 
 		 174 aa  88.2  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.978743  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2118  hypothetical protein  39.34 
 
 		 174 aa  88.2  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.130953  normal  0.854449 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2387  putative lipid carrier protein-like protein  39.34 
 
 		 174 aa  88.6  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0557516 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4295  putative lipid carrier protein-like  43.45 
 
 		 183 aa  84.3  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3474  hypothetical protein  36.36 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.498948  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4227  hypothetical protein  34.29 
 
 		 177 aa  73.9  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2400  putative lipid carrier protein-like protein  29.66 
 
 		 190 aa  67.8  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3493  putative lipid carrier protein-like protein  28.17 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0607  hypothetical protein  28.93 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03386  hypothetical protein  27.21 
 
 		 175 aa  43.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3090  sterol-binding domain-containing protein  40.74 
 
 		 134 aa  42.4  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002620  putative lipid carrier protein  26.03 
 
 		 175 aa  42.4  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3195  sterol-binding domain-containing protein  28.29 
 
 		 177 aa  41.6  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2119  hypothetical protein  23.48 
 
 		 204 aa  41.2  0.007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.145601  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0066  hypothetical protein  23.48 
 
 		 204 aa  41.2  0.007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3615  sterol-binding protein  25.56 
 
 		 174 aa  40.8  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>