26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5110 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5110  trimethylamine methyltransferase  100 
 
 		 511 aa  1055    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148591  normal  0.0268 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2171  trimethylamine methyltransferase  45.12 
 
 		 519 aa  443  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3128  trimethylamine methyltransferase  44.6 
 
 		 519 aa  427  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2817  trimethylamine methyltransferase  44.18 
 
 		 519 aa  419  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.322933 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1480  trimethylamine methyltransferase  40.29 
 
 		 504 aa  373  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.246816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1374  trimethylamine methyltransferase  39.11 
 
 		 514 aa  346  5e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.181279  normal  0.561281 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2813  putative trimethylamine methyltransferase protein  36.65 
 
 		 513 aa  336  7e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.94532  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1485  trimethylamine methyltransferase  36.65 
 
 		 513 aa  336  7e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.355063 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1716  trimethylamine methyltransferase  36.85 
 
 		 513 aa  335  1e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1586  trimethylamine methyltransferase  38.59 
 
 		 515 aa  329  7e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.091176 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2223  trimethylamine methyltransferase  38.19 
 
 		 519 aa  329  9e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0727835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4326  trimethylamine methyltransferase  37.29 
 
 		 476 aa  327  4.0000000000000003e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1775  trimethylamine methyltransferase  37.07 
 
 		 523 aa  324  3e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.445746  normal  0.0169643 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0432  trimethylamine methyltransferase  36.65 
 
 		 514 aa  311  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.57949 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1728  trimethylamine methyltransferase  36.62 
 
 		 468 aa  294  3e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4008  trimethylamine methyltransferase MttB-like protein  36.27 
 
 		 517 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4870  trimethylamine methyltransferase  27.94 
 
 		 471 aa  194  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1730  trimethylamine methyltransferase  28.3 
 
 		 476 aa  194  3e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1111  trimethylamine methyltransferase  27.04 
 
 		 477 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2313  trimethylamine:corrinoid methyltransferase  25.05 
 
 		 484 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0209756  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2196  trimethylamine methyltransferase  24.48 
 
 		 515 aa  127  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726169  normal  0.0249969 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1601  trimethylamine methyltransferase  22.76 
 
 		 510 aa  124  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.38036  normal  0.479948 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1467  trimethylamine methyltransferase  26 
 
 		 475 aa  105  1e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.657417  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2308  trimethylamine:corrinoid methyltransferase  24.37 
 
 		 334 aa  94.4  5e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0038557  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1109  trimethylamine:corrinoid methyltransferase-like protein  23.87 
 
 		 410 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1106  trimethylamine:corrinoid methyltransferase-like protein  24.62 
 
 		 417 aa  64.7  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.491742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>