11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4443 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4443  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  268  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.253642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5664  protein of unknown function DUF1486  52.21 
 
 		 257 aa  137  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5586  protein of unknown function DUF1486  53.1 
 
 		 118 aa  137  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4013  hypothetical protein  33.01 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.772114  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0684  putative taurine dehydrogenase, small subunit  29.73 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4362  protein of unknown function DUF1486  29.73 
 
 		 136 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.364126 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1992  hypothetical protein  30.91 
 
 		 132 aa  44.3  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.209953  normal  0.907507 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1830  hypothetical protein  25.22 
 
 		 128 aa  44.3  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.126678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1644  hypothetical protein  27.18 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.25271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1805  hypothetical protein  28.32 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.305211  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4515  hypothetical protein  31.37 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.275606 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>