More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4086 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5899  elongation factor G  75.96 
 
 		 653 aa  1019    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4086  elongation factor G  100 
 
 		 653 aa  1326    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.639909 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0922  elongation factor G  37.46 
 
 		 667 aa  451  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.122297  normal  0.0871733 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2247  elongation factor G  37.46 
 
 		 669 aa  451  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.040202  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2248  elongation factor G  36.73 
 
 		 670 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.456219 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1140  elongation factor G  36.99 
 
 		 671 aa  432  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1300  elongation factor G  39.43 
 
 		 688 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.196732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4119  elongation factor G  38.96 
 
 		 682 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.390379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4806  elongation factor G  39.11 
 
 		 683 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3921  elongation factor G  39 
 
 		 683 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1277  elongation factor G  38.64 
 
 		 686 aa  413  1e-114  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.836232  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1106  elongation factor G  38.22 
 
 		 699 aa  411  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.67028  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2978  elongation factor G  38.7 
 
 		 696 aa  405  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.493994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1818  elongation factor G  37.34 
 
 		 642 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237158 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1805  elongation factor G  38.56 
 
 		 655 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.504417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2110  elongation factor G  36.77 
 
 		 671 aa  386  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5234  elongation factor G  37.19 
 
 		 678 aa  389  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00485318 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5941  elongation factor G  36.99 
 
 		 678 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0130672  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0543  elongation factor G  36.24 
 
 		 660 aa  371  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.934068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3762  elongation factor G  33.83 
 
 		 681 aa  364  2e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0675022 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1634  elongation factor G  32.43 
 
 		 675 aa  361  2e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.100311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2771  elongation factor G  31.8 
 
 		 688 aa  348  1e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.252482  normal  0.08809 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3294  elongation factor G  32.89 
 
 		 680 aa  334  2e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2751  elongation factor G  35.32 
 
 		 661 aa  333  5e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1336  elongation factor G  31.39 
 
 		 678 aa  333  5e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1365  elongation factor G  31.39 
 
 		 678 aa  332  2e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0359186 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0279  small GTP-binding protein  31.78 
 
 		 676 aa  328  3e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2082  elongation factor G  33.28 
 
 		 662 aa  297  5e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0399925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1660  translation elongation factor G  29.97 
 
 		 691 aa  258  2e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00040628  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0879  small GTP-binding protein  26.5 
 
 		 690 aa  256  1.0000000000000001e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.323736  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1140  translation elongation factor G  28.59 
 
 		 683 aa  254  5.000000000000001e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.128625  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1178  translation elongation factor G  27.44 
 
 		 683 aa  249  8e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.747201  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1289  translation elongation factor G  27.22 
 
 		 685 aa  249  1e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0074  elongation factor G  27.17 
 
 		 696 aa  249  1e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  27.02 
 
 		 696 aa  248  2e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1541  translation elongation factor G  27 
 
 		 685 aa  245  1.9999999999999999e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2622  translation elongation factor G  28.87 
 
 		 697 aa  244  3e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000402697  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2910  translation elongation factor G  29.77 
 
 		 695 aa  244  5e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00946616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1486  elongation factor G  28.64 
 
 		 695 aa  244  5e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000303107  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  30.74 
 
 		 692 aa  242  2e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2318  small GTP-binding protein domain-containing protein  29.37 
 
 		 682 aa  242  2e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5121  translation elongation factor G  30.34 
 
 		 704 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.63953 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0947  translation elongation factor G, putative  26.92 
 
 		 692 aa  240  5.999999999999999e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.200709  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0188  elongation factor G  29.72 
 
 		 693 aa  239  1e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000059659  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0303  elongation factor G  29.67 
 
 		 700 aa  239  2e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383958 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2225  elongation factor G  28.2 
 
 		 680 aa  238  3e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  30.04 
 
 		 692 aa  238  3e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09730  translation elongation factor G  28.69 
 
 		 688 aa  238  3e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  28.59 
 
 		 692 aa  237  4e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  26.53 
 
 		 694 aa  237  6e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000276436  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  29.91 
 
 		 689 aa  237  6e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  29.18 
 
 		 692 aa  236  7e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  30.21 
 
 		 692 aa  236  8e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  29.97 
 
 		 692 aa  236  9e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  30.25 
 
 		 692 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  30.43 
 
 		 692 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2068  translation elongation factor G  28.87 
 
 		 689 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000450896  normal  0.835571 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  30.04 
 
 		 692 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1905  elongation factor G  30.11 
 
 		 691 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.224995  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  28.92 
 
 		 692 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  29.24 
 
 		 691 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  30.04 
 
 		 692 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  30.04 
 
 		 692 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  30.04 
 
 		 692 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  28.43 
 
 		 691 aa  235  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3923  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  29.48 
 
 		 703 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3926  elongation factor G  29.19 
 
 		 698 aa  234  3e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.955463  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  29.98 
 
 		 692 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0356  elongation factor G  29.63 
 
 		 691 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  31.31 
 
 		 680 aa  234  5e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2232  elongation factor G  28.78 
 
 		 704 aa  233  7.000000000000001e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000162154  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  27.06 
 
 		 695 aa  233  8.000000000000001e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0579  elongation factor G  29.63 
 
 		 698 aa  233  1e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5198  elongation factor G  29.89 
 
 		 692 aa  233  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000109677  unclonable  1.5030900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  27.44 
 
 		 692 aa  232  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0624  translation elongation factor G  30.17 
 
 		 705 aa  231  2e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2741  elongation factor G  27.12 
 
 		 686 aa  232  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.784554  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  26.67 
 
 		 692 aa  232  2e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  27.99 
 
 		 696 aa  232  2e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2662  translation elongation factor G  30.05 
 
 		 700 aa  231  3e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  27.6 
 
 		 692 aa  231  3e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  29.64 
 
 		 689 aa  231  4e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  29.98 
 
 		 692 aa  231  4e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2158  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  29.9 
 
 		 715 aa  231  4e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.959287  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6617  translation elongation factor G  29.82 
 
 		 700 aa  230  6e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  29.29 
 
 		 692 aa  230  7e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0584  elongation factor G  30.07 
 
 		 693 aa  229  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000768044  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  28.2 
 
 		 692 aa  229  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1188  elongation factor G  28.04 
 
 		 701 aa  229  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0286  elongation factor G  28.46 
 
 		 704 aa  229  1e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00220543  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0570  elongation factor G  30.07 
 
 		 693 aa  229  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000161061  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  27.17 
 
 		 695 aa  228  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1854  elongation factor G  28.57 
 
 		 704 aa  229  2e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000767386  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0289  elongation factor G  28.67 
 
 		 698 aa  228  2e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000225468  unclonable  2.3107599999999997e-27 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6052  elongation factor G  29.21 
 
 		 698 aa  228  4e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.274772 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1871  elongation factor G  29.14 
 
 		 696 aa  228  4e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00956938  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  27.29 
 
 		 691 aa  227  4e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0459  translation elongation factor G  29.1 
 
 		 690 aa  228  4e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000614779  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2537  elongation factor G  29.03 
 
 		 705 aa  227  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0339845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2403  elongation factor G  27.27 
 
 		 688 aa  227  5.0000000000000005e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>