More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3923 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009620  Smed_3923  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  100 
 
 
359 aa  741    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0450  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  79.94 
 
 
366 aa  614  1e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310283  normal  0.0618632 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4003  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  76.14 
 
 
354 aa  568  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260153  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3270  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  76.14 
 
 
354 aa  569  1e-161  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4019  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  76.7 
 
 
354 aa  568  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1194  fructose-bisphosphate aldolase, class II, Calvin cycle subtype  74.79 
 
 
361 aa  558  1e-158  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0390619 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1053  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  75.28 
 
 
361 aa  557  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.540808  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5123  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  75.57 
 
 
361 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6398  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  74.72 
 
 
360 aa  551  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.698426  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0950  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  73.86 
 
 
361 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2896  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  73.3 
 
 
361 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.399813  normal  0.179502 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2692  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  73.58 
 
 
361 aa  541  1e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.108693  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4048  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  73.3 
 
 
361 aa  541  1e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.729421  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3752  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  73.3 
 
 
361 aa  541  1e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7283  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  71.51 
 
 
362 aa  533  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0373571  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2942  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  72.42 
 
 
359 aa  530  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2325  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  70.45 
 
 
355 aa  528  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320028  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1283  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  72.14 
 
 
359 aa  528  1e-149  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0596  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  70.37 
 
 
354 aa  528  1e-149  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0823  fructose-bisphosphate aldolase, class II  72.36 
 
 
359 aa  526  1e-148  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2713  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  71.59 
 
 
359 aa  526  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0156  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  69.89 
 
 
356 aa  526  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.191735 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1698  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  71.31 
 
 
359 aa  522  1e-147  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.0076037  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0871  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  69.03 
 
 
354 aa  521  1e-147  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6004  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  70.37 
 
 
362 aa  524  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.086132  decreased coverage  0.00313463 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2369  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  69.6 
 
 
355 aa  522  1e-147  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.545417 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2646  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  69.6 
 
 
355 aa  522  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.292128  normal  0.550526 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2904  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  69.6 
 
 
354 aa  523  1e-147  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0818  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  68.75 
 
 
354 aa  519  1e-146  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.942349  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5315  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  70.09 
 
 
354 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6928  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  67.61 
 
 
355 aa  508  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.826361  normal  0.18115 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0765  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  68.19 
 
 
363 aa  510  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.290883  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2844  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  67.05 
 
 
354 aa  485  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0994  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.69 
 
 
359 aa  479  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135805  normal  0.788402 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0967  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.41 
 
 
359 aa  478  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0166  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.94 
 
 
359 aa  480  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0304491 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2029  fructose-bisphosphate aldolase, class II, Calvin cycle subtype  64.18 
 
 
359 aa  475  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.394674  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0163  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  64.31 
 
 
355 aa  472  1e-132  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0408428 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1912  fructose-bisphosphate aldolase, class II  64.76 
 
 
354 aa  472  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.326014  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0384  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.14 
 
 
354 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0370  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  65.34 
 
 
354 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1443  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.28 
 
 
357 aa  465  9.999999999999999e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.66755  normal  0.139145 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3041  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  64.1 
 
 
354 aa  463  1e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0163377  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3047  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  64.1 
 
 
354 aa  463  1e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.589963  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2793  fructose-bisphosphate aldolase  65.22 
 
 
345 aa  464  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.918989  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2386  fructose-bisphosphate aldolase, class II, Calvin cycle subtype  63.64 
 
 
354 aa  461  1e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.109398 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3624  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  64.83 
 
 
345 aa  462  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.113592  normal  0.210537 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2492  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.2 
 
 
359 aa  463  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.180719 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0248  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  64.76 
 
 
354 aa  462  1e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074313  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05600  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.61 
 
 
354 aa  464  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.933141  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4602  fructose-bisphosphate aldolase  63.9 
 
 
357 aa  463  1e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200924  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0405  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  62.71 
 
 
354 aa  461  9.999999999999999e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.841441  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2889  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.07 
 
 
354 aa  460  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0229  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  61.9 
 
 
363 aa  460  9.999999999999999e-129  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.58536  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0789  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.56 
 
 
357 aa  458  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08421  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.56 
 
 
357 aa  458  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.201369  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1974  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  61.9 
 
 
363 aa  460  9.999999999999999e-129  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4099  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  61.73 
 
 
359 aa  460  9.999999999999999e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.109682  normal  0.324334 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1039  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.07 
 
 
354 aa  460  9.999999999999999e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3037  fructose-bisphosphate aldolase, class II  63.28 
 
 
354 aa  456  1e-127  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0462  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  62.18 
 
 
354 aa  456  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0797  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.64 
 
 
357 aa  455  1e-127  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.162751  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2243  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  65.61 
 
 
349 aa  456  1e-127  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0152373 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3022  fructose-bisphosphate aldolase, class II, Calvin cycle subtype  66.67 
 
 
338 aa  456  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625607  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08441  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.56 
 
 
357 aa  457  1e-127  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5009  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  62.46 
 
 
354 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.694536 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2849  fructose-bisphosphate aldolase, class II, Calvin cycle subtype  63.07 
 
 
356 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0980884  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3248  fructose-bisphosphate aldolase, class II  63.07 
 
 
356 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0875  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  61.93 
 
 
355 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0933  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  61.93 
 
 
355 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0658  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  61.65 
 
 
354 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.76632  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08011  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  62.71 
 
 
357 aa  451  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0594842  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5262  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  62.29 
 
 
354 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1857  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.46 
 
 
357 aa  451  1.0000000000000001e-126  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.114084  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0755  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  62.5 
 
 
354 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.119495  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0776  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  61.93 
 
 
355 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0266968  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3247  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  61.93 
 
 
355 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0347517  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3218  fructose-bisphosphate aldolase  61.93 
 
 
354 aa  452  1.0000000000000001e-126  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.338247  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3350  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  61.93 
 
 
355 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000198413  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4960  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  62.18 
 
 
354 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1489  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  60.46 
 
 
354 aa  451  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.156888  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4683  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  61.56 
 
 
347 aa  449  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.105194  normal  0.371454 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3537  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  61.65 
 
 
355 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0830  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  61.65 
 
 
355 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.254898  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3462  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  61.65 
 
 
355 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0506  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  62.18 
 
 
354 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1086  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  61.65 
 
 
355 aa  449  1e-125  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000814215  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0791  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  61.86 
 
 
354 aa  450  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.475428  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0877  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  61.86 
 
 
354 aa  450  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000290228  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4833  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  62.18 
 
 
354 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0879  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  61.58 
 
 
354 aa  449  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07230  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  61.36 
 
 
354 aa  451  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3656  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  61.65 
 
 
355 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09801  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.92 
 
 
357 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.137925  normal  0.129701 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2804  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  61.36 
 
 
354 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2756  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  61.36 
 
 
355 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0650  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  61.65 
 
 
354 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0196207  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0390  fructose-bisphosphate aldolase, class II  61.89 
 
 
354 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4787  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  61.32 
 
 
354 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.111053 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0493  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  58.74 
 
 
354 aa  435  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85021  normal  0.786226 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>