14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3461 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3461  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  337  5e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.81748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4248  hypothetical protein  42.11 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0812  BA14K family protein  48.91 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4513  BA14K family protein  58.33 
 
 		 139 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.050072  decreased coverage  0.007325 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0210  hypothetical protein  61.76 
 
 		 147 aa  51.6  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.434123  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1502  BA14K family protein  54.05 
 
 		 193 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0693062  normal  0.528738 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1399  BA14K family protein  48.65 
 
 		 193 aa  48.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.500757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0671  BA14K family protein  54.17 
 
 		 157 aa  46.6  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.769425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1878  hypothetical protein  47.22 
 
 		 229 aa  44.7  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.382296  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1780  BA14K family protein  29.38 
 
 		 156 aa  44.7  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00576599 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1497  BA14K-like  36.36 
 
 		 160 aa  42.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00686044  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0598  BA14K family protein  52.78 
 
 		 159 aa  42.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141665  normal  0.508547 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3884  BA14K family protein  32.38 
 
 		 151 aa  42  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.339312  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0486  BA14K family protein  55.56 
 
 		 137 aa  41.6  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>