11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4513 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_4513  BA14K family protein  100 
 
 
139 aa  284  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.050072  decreased coverage  0.007325 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4248  hypothetical protein  85 
 
 
138 aa  208  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3461  hypothetical protein  58.33 
 
 
177 aa  54.3  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.81748  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1502  BA14K family protein  42.86 
 
 
193 aa  51.2  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0693062  normal  0.528738 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0210  hypothetical protein  46.15 
 
 
147 aa  47.4  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.434123  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0550  BA14K family protein  48.84 
 
 
156 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353622  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0598  BA14K family protein  48.84 
 
 
159 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141665  normal  0.508547 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1399  BA14K family protein  38.1 
 
 
193 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.500757  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1878  hypothetical protein  40.48 
 
 
229 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.382296  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1377  hypothetical protein  36.73 
 
 
171 aa  40  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1335  hypothetical protein  36.73 
 
 
171 aa  40  0.01  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.20154  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>