26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2196 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1601  trimethylamine methyltransferase  67.15 
 
 		 510 aa  684    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.38036  normal  0.479948 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2196  trimethylamine methyltransferase  100 
 
 		 515 aa  1056    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726169  normal  0.0249969 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4326  trimethylamine methyltransferase  27.29 
 
 		 476 aa  194  3e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2313  trimethylamine:corrinoid methyltransferase  26.72 
 
 		 484 aa  190  5.999999999999999e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0209756  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1111  trimethylamine methyltransferase  27.87 
 
 		 477 aa  182  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1728  trimethylamine methyltransferase  24.95 
 
 		 468 aa  177  5e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2171  trimethylamine methyltransferase  26.47 
 
 		 519 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1730  trimethylamine methyltransferase  25.21 
 
 		 476 aa  147  6e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1374  trimethylamine methyltransferase  28.24 
 
 		 514 aa  145  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.181279  normal  0.561281 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2817  trimethylamine methyltransferase  28.93 
 
 		 519 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.322933 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1775  trimethylamine methyltransferase  25.58 
 
 		 523 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.445746  normal  0.0169643 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4008  trimethylamine methyltransferase MttB-like protein  25.59 
 
 		 517 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2813  putative trimethylamine methyltransferase protein  26.85 
 
 		 513 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.94532  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1485  trimethylamine methyltransferase  26.85 
 
 		 513 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.355063 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1716  trimethylamine methyltransferase  26.77 
 
 		 513 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4870  trimethylamine methyltransferase  25.75 
 
 		 471 aa  133  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5110  trimethylamine methyltransferase  24.85 
 
 		 511 aa  133  6.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148591  normal  0.0268 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1586  trimethylamine methyltransferase  27.02 
 
 		 515 aa  133  9e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.091176 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0432  trimethylamine methyltransferase  26.01 
 
 		 514 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.57949 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3128  trimethylamine methyltransferase  26.2 
 
 		 519 aa  127  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1467  trimethylamine methyltransferase  27.06 
 
 		 475 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.657417  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2308  trimethylamine:corrinoid methyltransferase  27.93 
 
 		 334 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0038557  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2223  trimethylamine methyltransferase  25.91 
 
 		 519 aa  121  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0727835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1480  trimethylamine methyltransferase  26.12 
 
 		 504 aa  114  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.246816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2309  trimethylamine:corrinoid methyltransferase  23.57 
 
 		 147 aa  49.7  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00021948  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1109  trimethylamine:corrinoid methyltransferase-like protein  20.79 
 
 		 410 aa  47.8  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>