42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1896 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1896  hypothetical protein  100 
 
 		 443 aa  918    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2716  Phage uncharacterized protein-like  50.34 
 
 		 458 aa  417  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3043  protein of unknown function DUF264  49.42 
 
 		 435 aa  386  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0633  hypothetical protein  43.28 
 
 		 509 aa  342  9e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3628  hypothetical protein  46.71 
 
 		 690 aa  281  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3704  hypothetical protein  53.68 
 
 		 446 aa  233  6e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2464  hypothetical protein  80 
 
 		 140 aa  212  9e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.226306  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2102  protein of unknown function DUF264  44.8 
 
 		 386 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000296249  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0585  terminase large subunit, putative  44.93 
 
 		 384 aa  171  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0586  putative terminase large subunit  44.93 
 
 		 380 aa  166  5.9999999999999996e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1074  hypothetical protein  48.47 
 
 		 414 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.541704  normal  0.984253 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3472  hypothetical protein  43.32 
 
 		 431 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1976  hypothetical protein  42.17 
 
 		 370 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.493623  normal  0.545091 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2902  hypothetical protein  47.4 
 
 		 463 aa  159  7e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.176162  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1708  protein of unknown function DUF264  45.41 
 
 		 421 aa  157  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.644471  normal  0.0322658 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0902  hypothetical protein  53.76 
 
 		 448 aa  157  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225304 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2178  hypothetical protein  32.53 
 
 		 452 aa  157  4e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1631  hypothetical protein  49.43 
 
 		 483 aa  156  7e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.576046  normal  0.91477 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3147  hypothetical protein  39.84 
 
 		 416 aa  156  8e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.284595  normal  0.0189351 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1434  hypothetical protein  43.37 
 
 		 458 aa  153  5e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.834365 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4961  hypothetical protein  42.22 
 
 		 432 aa  150  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000421894 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1800  hypothetical protein  40.79 
 
 		 423 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.983484  normal  0.0740588 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1430  protein of unknown function DUF264  42.28 
 
 		 421 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.396368 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1408  hypothetical protein  41.26 
 
 		 422 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1160  hypothetical protein  40.36 
 
 		 422 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.375561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1057  hypothetical protein  41.3 
 
 		 425 aa  147  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0533808 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3118  hypothetical protein  41.99 
 
 		 440 aa  146  7.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1330  large terminase  41.15 
 
 		 459 aa  145  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.334164  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3490  hypothetical protein  41.07 
 
 		 423 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1964  hypothetical protein  39.64 
 
 		 386 aa  143  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.817651 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1129  hypothetical protein  44.9 
 
 		 414 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.918879  normal  0.929699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2467  putative large terminase  44.9 
 
 		 414 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3918  hypothetical protein  30.82 
 
 		 439 aa  140  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0145321 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0918  hypothetical protein  33.61 
 
 		 450 aa  122  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.415062 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2004  hypothetical protein  29.71 
 
 		 436 aa  121  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0120622 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0384  hypothetical protein  57.69 
 
 		 426 aa  92.4  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.22896  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3888  hypothetical protein  29 
 
 		 496 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2467  hypothetical protein  25.53 
 
 		 491 aa  46.2  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.408666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2551  hypothetical protein  23.81 
 
 		 497 aa  45.8  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3380  hypothetical protein  22.54 
 
 		 433 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.835336 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3419  hypothetical protein  22.54 
 
 		 433 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  unclonable  1.80446e-16 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3483  hypothetical protein  23.88 
 
 		 453 aa  43.5  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>