26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1775 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2813  putative trimethylamine methyltransferase protein  64.24 
 
 		 513 aa  691    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.94532  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1775  trimethylamine methyltransferase  100 
 
 		 523 aa  1082    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.445746  normal  0.0169643 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1716  trimethylamine methyltransferase  61.11 
 
 		 513 aa  676    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1485  trimethylamine methyltransferase  64.24 
 
 		 513 aa  691    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.355063 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1374  trimethylamine methyltransferase  64.32 
 
 		 514 aa  680    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.181279  normal  0.561281 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1586  trimethylamine methyltransferase  60.04 
 
 		 515 aa  628  1e-179  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.091176 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2223  trimethylamine methyltransferase  60.37 
 
 		 519 aa  626  1e-178  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0727835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0432  trimethylamine methyltransferase  56.05 
 
 		 514 aa  578  1e-164  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.57949 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4008  trimethylamine methyltransferase MttB-like protein  45.32 
 
 		 517 aa  451  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4326  trimethylamine methyltransferase  44.87 
 
 		 476 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2171  trimethylamine methyltransferase  41.81 
 
 		 519 aa  358  9.999999999999999e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3128  trimethylamine methyltransferase  41.05 
 
 		 519 aa  343  5.999999999999999e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1728  trimethylamine methyltransferase  37.1 
 
 		 468 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2817  trimethylamine methyltransferase  40.08 
 
 		 519 aa  324  3e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.322933 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5110  trimethylamine methyltransferase  36.78 
 
 		 511 aa  322  9.999999999999999e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148591  normal  0.0268 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1480  trimethylamine methyltransferase  35.03 
 
 		 504 aa  250  5e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.246816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4870  trimethylamine methyltransferase  30.19 
 
 		 471 aa  242  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1730  trimethylamine methyltransferase  30.89 
 
 		 476 aa  241  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1111  trimethylamine methyltransferase  27.81 
 
 		 477 aa  145  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2313  trimethylamine:corrinoid methyltransferase  24.15 
 
 		 484 aa  139  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0209756  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1467  trimethylamine methyltransferase  29.36 
 
 		 475 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.657417  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2196  trimethylamine methyltransferase  25.58 
 
 		 515 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726169  normal  0.0249969 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1601  trimethylamine methyltransferase  27.66 
 
 		 510 aa  126  8.000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.38036  normal  0.479948 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2308  trimethylamine:corrinoid methyltransferase  24.37 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0038557  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2309  trimethylamine:corrinoid methyltransferase  27.82 
 
 		 147 aa  57.4  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00021948  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1109  trimethylamine:corrinoid methyltransferase-like protein  23.8 
 
 		 410 aa  46.6  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>