14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1074 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1074  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  571  1.0000000000000001e-162  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.974641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0885  hypothetical protein  56.76 
 
 		 541 aa  91.7  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4859  hypothetical protein  49.37 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0267663  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7204  hypothetical protein  44 
 
 		 224 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.462039  normal  0.0379307 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0738  hypothetical protein  44.44 
 
 		 334 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.546157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2342  hypothetical protein  46.15 
 
 		 408 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1817  hypothetical protein  42.19 
 
 		 532 aa  53.1  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0270492  hitchhiker  0.00149176 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0237  hypothetical protein  43.48 
 
 		 322 aa  52  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3346  hypothetical protein  37.5 
 
 		 650 aa  50.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4460  hypothetical protein  41.89 
 
 		 424 aa  47.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3344  hypothetical protein  36.11 
 
 		 397 aa  47.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3029  hypothetical protein  38.57 
 
 		 323 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3856  hypothetical protein  35.29 
 
 		 461 aa  42.7  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.40054  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0235  hypothetical protein  30.34 
 
 		 392 aa  42.4  0.009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>