10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1817 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1817  hypothetical protein  100 
 
 		 532 aa  1060    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0270492  hitchhiker  0.00149176 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0738  hypothetical protein  41.51 
 
 		 334 aa  103  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.546157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0237  hypothetical protein  41.29 
 
 		 322 aa  98.6  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2342  hypothetical protein  38.18 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4460  hypothetical protein  42.65 
 
 		 424 aa  52  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1074  hypothetical protein  42.19 
 
 		 284 aa  50.4  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.974641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3029  hypothetical protein  37.66 
 
 		 323 aa  45.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3344  hypothetical protein  29.31 
 
 		 397 aa  45.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0183  hypothetical protein  36 
 
 		 1168 aa  43.9  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.852248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0885  hypothetical protein  39.06 
 
 		 541 aa  43.5  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>