19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1726 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1726  hypothetical protein  100 
 
 
94 aa  180  7e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.525839  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00810  hypothetical protein  58.51 
 
 
95 aa  114  5e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.471947  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2142  hypothetical protein  48.86 
 
 
102 aa  92.4  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2057  hypothetical protein  47.62 
 
 
97 aa  77.4  0.00000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1385  HesB/YadR/YfhF  46.07 
 
 
105 aa  63.9  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000550441  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3028  hypothetical protein  38.46 
 
 
133 aa  50.8  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3135  hypothetical protein  37.14 
 
 
228 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.376033 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0670  hypothetical protein  32.47 
 
 
181 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2937  hypothetical protein  35.96 
 
 
129 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.875115 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3032  hypothetical protein  37.88 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000576055  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2859  hypothetical protein  39.02 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5044  hypothetical protein  42.42 
 
 
184 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2703  hypothetical protein  45.45 
 
 
160 aa  45.1  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1888  hypothetical protein  43.33 
 
 
254 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.523825  normal  0.632481 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0271  hypothetical protein  41.79 
 
 
190 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.528564 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0724  hypothetical protein  32.1 
 
 
178 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.262033 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0397  hypothetical protein  35.94 
 
 
137 aa  41.6  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.334737  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1470  hypothetical protein  35.16 
 
 
104 aa  40.8  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.856687  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4437  hypothetical protein  34.67 
 
 
484 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0486392 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>