28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0588 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0588  membrane-bound metal-dependent hydrolase  100 
 
 		 193 aa  372  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.455878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04381  inner membrane protein YbcI  67.19 
 
 		 191 aa  224  9e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1266  putative metal-dependent hydrolase, membrane-bound  48.57 
 
 		 182 aa  149  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1380  membrane-bound metal-dependent hydrolase  48.57 
 
 		 182 aa  149  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3150  hypothetical protein  48.57 
 
 		 182 aa  149  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.552218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5691  inner membrane protein YbcI  51.16 
 
 		 179 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0593  inner membrane protein YbcI  49.42 
 
 		 181 aa  138  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.417884  normal  0.0138038 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0648  hypothetical protein  49.42 
 
 		 181 aa  138  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0588  inner membrane protein YbcI  49.42 
 
 		 181 aa  138  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.337402 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0585  inner membrane protein YbcI  48.31 
 
 		 181 aa  137  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0279815 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0586  inner membrane protein YbcI  47.75 
 
 		 181 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.150683  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0628  hypothetical protein  47.09 
 
 		 173 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0247504  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00482  hypothetical protein  46.51 
 
 		 173 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.275959  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00477  conserved inner membrane protein  46.51 
 
 		 173 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.185455  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0567  hypothetical protein  46.51 
 
 		 173 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000105687  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65580  putative membrane-bound metal-dependent hydrolase  52.33 
 
 		 178 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0447  hypothetical protein  46.51 
 
 		 173 aa  134  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000487062  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3086  membrane-bound metal-dependent hydrolase  46.51 
 
 		 173 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000669215  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3095  membrane-bound metal-dependent hydrolase  44.81 
 
 		 173 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0342727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0602  hypothetical protein  46.51 
 
 		 173 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000045607  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0572  hypothetical protein  45.35 
 
 		 173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0154428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4023  membrane-bound metal-dependent hydrolase  43.35 
 
 		 183 aa  119  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04870  hypothetical protein  32.43 
 
 		 334 aa  46.6  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.499704  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2345  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.88 
 
 		 341 aa  45.8  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000015243  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0040  hypothetical protein  33.33 
 
 		 331 aa  45.1  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4246  membrane-bound metal-dependent hydrolase  37.04 
 
 		 351 aa  44.7  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0041  hypothetical protein  34.33 
 
 		 331 aa  43.9  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0477  membrane-bound metal-dependent hydrolase  27.01 
 
 		 162 aa  42  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>