More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0501 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0501  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  100 
 
 
312 aa  610  1e-173  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.389886  normal  0.120747 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03167  electron transfer flavoprotein alpha subunit  83.07 
 
 
313 aa  481  1e-135  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0222  electron transfer flavoprotein alpha subunit  72.29 
 
 
316 aa  461  1e-129  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0193  electron transfer flavoprotein alpha subunit  72.29 
 
 
316 aa  461  1e-129  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3773  electron transfer flavoprotein alpha subunit  58.71 
 
 
309 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3525  electron transfer flavoprotein alpha subunit  58.39 
 
 
309 aa  325  5e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4201  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  59.03 
 
 
309 aa  325  7e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1652  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  59.03 
 
 
309 aa  325  7e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2210  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  58.33 
 
 
309 aa  310  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16420  Electron transfer flavoprotein, alpha subunit  59.16 
 
 
309 aa  308  6.999999999999999e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0845524  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1470  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  58.01 
 
 
313 aa  303  2.0000000000000002e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0862538  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1577  electron transfer flavoprotein alpha subunit  52.75 
 
 
309 aa  303  4.0000000000000003e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519055 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3159  electron transfer flavoprotein alpha subunit  53.55 
 
 
309 aa  301  7.000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00997  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  54.69 
 
 
308 aa  301  1e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.325031  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4916  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  57.1 
 
 
309 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1997  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  55.27 
 
 
312 aa  299  4e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.11647  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25880  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  58.33 
 
 
309 aa  299  4e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.272339  normal  0.0503737 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15190  Electron transfer flavoprotein, alpha subunit  59.55 
 
 
309 aa  298  7e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3034  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  56.91 
 
 
309 aa  298  8e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1607  electron transfer flavoprotein alpha subunit  54.22 
 
 
313 aa  298  1e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3562  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  56.77 
 
 
309 aa  297  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17521  normal  0.383199 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1012  electron transfer flavoprotein alpha subunit  56.45 
 
 
309 aa  298  1e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4116  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  58.44 
 
 
309 aa  296  3e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.146576 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1614  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  55.95 
 
 
308 aa  296  3e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.455824  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2145  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  52.1 
 
 
308 aa  296  4e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104749  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0655  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  52.46 
 
 
309 aa  295  5e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.304729  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2186  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  56.96 
 
 
309 aa  295  8e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9248  electron transfer flavoprotein alpha subunit  56.45 
 
 
319 aa  293  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0619808  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14290  Electron transfer flavoprotein, alpha subunit  58.58 
 
 
310 aa  292  4e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2173  electron transfer flavoprotein subunit alpha  57.84 
 
 
309 aa  292  6e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4828  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  56.41 
 
 
309 aa  292  6e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal  0.92553 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2583  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  52.75 
 
 
307 aa  291  7e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000711397  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1970  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  55.48 
 
 
309 aa  291  9e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1895  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  55.48 
 
 
349 aa  291  9e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.470782  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3144  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  54.1 
 
 
308 aa  291  1e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2747  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  54.55 
 
 
307 aa  291  1e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000476091  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1038  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  53.23 
 
 
309 aa  290  2e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.434498  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0615  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  53.7 
 
 
310 aa  290  3e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0862731  normal  0.336717 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2557  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  55.77 
 
 
308 aa  288  8e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0219  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  55.45 
 
 
311 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0410  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  55.45 
 
 
311 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2976  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  55.45 
 
 
311 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3078  electron transfer flavoprotein  55.81 
 
 
311 aa  288  1e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0457  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  54.43 
 
 
310 aa  288  1e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.196696  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3168  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  54.43 
 
 
310 aa  288  1e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.929742  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6871  electron transfer flavoprotein alpha subunit  54.05 
 
 
310 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.496098  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2554  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  55.45 
 
 
311 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2927  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  55.45 
 
 
311 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0930  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  55.45 
 
 
311 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3688  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  51.76 
 
 
308 aa  287  2e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0763  electron transfer flavoprotein alpha subunit  55.13 
 
 
311 aa  286  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5231  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  54.69 
 
 
314 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0165926  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4176  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  56.17 
 
 
311 aa  286  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0387842  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2854  electron transfer flavoprotein alpha subunit  51.15 
 
 
307 aa  286  4e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6308  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  52.58 
 
 
310 aa  285  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2533  electron transfer flavoprotein alpha subunit  54.19 
 
 
309 aa  285  5.999999999999999e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0939  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  55.77 
 
 
311 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1654  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  55.13 
 
 
311 aa  285  7e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1022  electron transfer flavoprotein alpha subunit  55.19 
 
 
311 aa  285  7e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2866  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  54.81 
 
 
311 aa  285  7e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.786227  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0179  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  53.87 
 
 
309 aa  285  8e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0943  electron transfer flavoprotein alpha subunit  55.13 
 
 
311 aa  285  9e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.94647  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2994  electron transfer flavoprotein alpha subunit  53.23 
 
 
308 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0210477  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2241  electron transfer flavoprotein alpha subunit  55.13 
 
 
311 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0584  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  55.05 
 
 
311 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.292903  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2865  electron transfer flavoprotein alpha subunit  53.23 
 
 
308 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000168731  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1063  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  55.05 
 
 
311 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.760076  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2706  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  57.98 
 
 
309 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.796213  normal  0.172174 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0858  electron transfer flavoprotein alpha subunit  54.63 
 
 
309 aa  283  3.0000000000000004e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2364  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  53.4 
 
 
309 aa  283  3.0000000000000004e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1406  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  54.69 
 
 
308 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000428424  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1170  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  55.41 
 
 
307 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000857296  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2846  electron transfer flavoprotein alpha subunit  53.23 
 
 
308 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000985781  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3195  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  53.18 
 
 
309 aa  282  4.0000000000000003e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.234178  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1990  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  52.24 
 
 
311 aa  282  5.000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1512  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  52.9 
 
 
308 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000305192  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1690  electron transfer flavoprotein subunit alpha  54.34 
 
 
308 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1353  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  55.08 
 
 
308 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000384606  hitchhiker  0.00895875 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1418  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  55.08 
 
 
308 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0628091  normal  0.474151 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3235  electron transfer flavoprotein alpha subunit  50.82 
 
 
307 aa  281  9e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.320471 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2984  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  54.87 
 
 
311 aa  280  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0824213  decreased coverage  0.00070323 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2809  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  55.59 
 
 
310 aa  280  2e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.22973  normal  0.220187 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1996  electron transfer flavoprotein subunit alpha  55.48 
 
 
309 aa  280  3e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.569896  normal  0.163293 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0754  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  52.09 
 
 
314 aa  280  3e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0323  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  54.05 
 
 
308 aa  279  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.501158  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1212  electron transfer flavoprotein beta-subunit:electron transfer flavoprotein, alpha subunit  56.68 
 
 
310 aa  278  8e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1446  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  50.49 
 
 
307 aa  276  2e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198023  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2538  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  52.9 
 
 
307 aa  277  2e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000412152  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4189  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  54.87 
 
 
310 aa  276  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000806502 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2510  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  51.13 
 
 
308 aa  276  3e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000427922  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1297  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  54.37 
 
 
309 aa  275  7e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0755964 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0999  electron transfer flavoprotein subunit alpha  53.8 
 
 
315 aa  275  9e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3855  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  55.56 
 
 
313 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.350999 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001582  electron transfer flavoprotein alpha subunit  48.71 
 
 
321 aa  273  2.0000000000000002e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0954  electron transfer flavoprotein subunit alpha  48.71 
 
 
312 aa  273  3e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2298  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  53.55 
 
 
310 aa  272  5.000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0528  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  54.07 
 
 
310 aa  272  6e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000381048  hitchhiker  0.00976807 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3480  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  53.07 
 
 
314 aa  272  7e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.95014  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7299  electron transfer flavoprotein subunit alpha/beta  53.97 
 
 
314 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0555297  normal  0.847795 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0985  electron transfer flavoprotein subunit alpha  48.39 
 
 
312 aa  271  9e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>