15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6897 on replicon NC_013732
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013732  Slin_6897  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  513  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6651  hypothetical protein  86.17 
 
 
253 aa  450  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.240923  normal  0.142646 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2338  hypothetical protein  41.35 
 
 
253 aa  182  6e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00341  hypothetical protein  38.1 
 
 
252 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0092  hypothetical protein  39.13 
 
 
235 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.237058 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0202  hypothetical protein  37.55 
 
 
247 aa  142  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1086  hypothetical protein  34.93 
 
 
231 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0194  hypothetical protein  37.05 
 
 
234 aa  126  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2467  hypothetical protein  37.3 
 
 
241 aa  107  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.424462 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2335  hypothetical protein  34.5 
 
 
242 aa  92.8  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0300  hypothetical protein  24.19 
 
 
298 aa  47  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0452  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.27 
 
 
304 aa  47  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.420259 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1145  hypothetical protein  33.71 
 
 
192 aa  44.7  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.182346  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1441  hypothetical protein  30.65 
 
 
208 aa  43.1  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00299973  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0992  hypothetical protein  31.68 
 
 
180 aa  42  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000454439  unclonable  0.00000572883 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>