14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5861 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5861  HIRAN protein  100 
 
 		 178 aa  363  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.447578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0535  HIRAN protein  33.78 
 
 		 131 aa  57  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.165002  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2446  HIRAN protein  30.21 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.787509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3936  hypothetical protein  37.33 
 
 		 135 aa  53.9  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.381249 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0502  hypothetical protein  31.08 
 
 		 121 aa  53.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.434953 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1727  hypothetical protein  30.67 
 
 		 137 aa  53.5  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.571783  normal  0.761634 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23760  HIRAN domain-containing protein  34.18 
 
 		 227 aa  50.4  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0079  HIRAN  30.69 
 
 		 333 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26720  HIRAN domain-containing protein  34.21 
 
 		 136 aa  49.7  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02256  SNF2 family helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06590)  30.23 
 
 		 972 aa  44.7  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.362577 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0283  HIRAN  26.19 
 
 		 248 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05190  SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 3, putative  24.58 
 
 		 900 aa  42.7  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0035  hypothetical protein  25.97 
 
 		 250 aa  42.4  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0734  HIRAN  32.47 
 
 		 133 aa  40.8  0.01  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>