32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5638 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5638  SNARE associated Golgi protein-like protein  100 
 
 
223 aa  439  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3984  SNARE associated Golgi protein  43.94 
 
 
210 aa  159  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000349045  normal  0.413743 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10356  predicted protein  26.97 
 
 
149 aa  63.2  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.581519  hitchhiker  0.00659258 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18091  hypothetical protein  33.03 
 
 
213 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.95558  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0336  SNARE associated Golgi protein  31.73 
 
 
243 aa  55.1  0.0000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.100106  normal  0.720347 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18721  hypothetical protein  34.65 
 
 
198 aa  53.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.564165  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18911  hypothetical protein  33.66 
 
 
200 aa  52.4  0.000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.550079  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1774  hypothetical protein  32 
 
 
198 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  25 
 
 
250 aa  49.3  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  27.96 
 
 
229 aa  48.5  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21521  hypothetical protein  27.33 
 
 
213 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1280  hypothetical protein  30.84 
 
 
207 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.932372  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2554  hypothetical protein  28.4 
 
 
207 aa  47  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2208  hypothetical protein  37.5 
 
 
206 aa  46.6  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.569423  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2631  hypothetical protein  21.43 
 
 
245 aa  46.2  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3205  phospholipase D/transphosphatidylase  33.33 
 
 
735 aa  46.2  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  29.76 
 
 
239 aa  46.2  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  26.95 
 
 
722 aa  45.8  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4073  SNARE associated Golgi protein  21.74 
 
 
209 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4112  SNARE associated Golgi protein  21.74 
 
 
209 aa  45.1  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00687322  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18721  hypothetical protein  29.07 
 
 
203 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.96466  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  23.53 
 
 
238 aa  43.9  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  21.55 
 
 
242 aa  43.5  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4331  SNARE associated Golgi protein  24.03 
 
 
232 aa  43.1  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4700  SNARE associated Golgi protein  23.66 
 
 
232 aa  43.5  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0431705  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1119  hypothetical protein  28.75 
 
 
225 aa  43.1  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  27.97 
 
 
732 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  27.97 
 
 
732 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  22.54 
 
 
242 aa  42.4  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  27.97 
 
 
732 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  20.39 
 
 
264 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_31234  predicted protein  23.77 
 
 
174 aa  42  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.066629  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>