36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4813 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4813  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  100 
 
 		 173 aa  358  2e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.841507  normal  0.227045 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3931  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  64.53 
 
 		 177 aa  217  7e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0185  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  39.46 
 
 		 158 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0259  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  37.67 
 
 		 153 aa  115  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1213  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase and related enzyme  33.79 
 
 		 154 aa  108  4.0000000000000004e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2403  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5 epimerase  36.99 
 
 		 158 aa  106  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.930193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1887  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  35.1 
 
 		 181 aa  100  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.394283  normal  0.415914 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2142  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  35.81 
 
 		 155 aa  100  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2215  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  30.36 
 
 		 181 aa  96.3  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1910  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  32.89 
 
 		 149 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0165  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase related  32.24 
 
 		 151 aa  85.5  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0055  dTDP-4-dehydrorhamnose 35-epimerase related  29.53 
 
 		 153 aa  77  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2887  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  31.97 
 
 		 147 aa  73.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.749725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3696  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  27.7 
 
 		 173 aa  70.9  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1604  dTDP-4-dehydrorhamnose epimerase  31.11 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.679828  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1352  dTDP-4-dehydrorhamnose 3 5-epimerase and related enzymes-like protein  30.6 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0875  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  34.51 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0925  hypothetical protein  27.41 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.540819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2861  dTDP-4-dehydrorhamnose 3 5-epimerase and related enzymes-like protein  31.06 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000254374  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2752  dTDP-4-dehydrorhamnose 35-epimerase related protein  31.76 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.711856  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2082  hypothetical protein  27.34 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2030  dTDP-4-dehydrorhamnose 3 5-epimerase  35.05 
 
 		 137 aa  52.4  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1766  hypothetical protein  24.32 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1754  dTDP-4-dehydrorhamnose 3 5-epimerase and related enzymes-like protein  26.72 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1794  hypothetical protein  24.32 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000547982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0540  dTDP-4-dehydrorhamnose 35-epimerase related  29.57 
 
 		 180 aa  48.5  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2463  dTDP-4-dehydrorhamnose 3 5-epimerase and related enzymes-like protein  26.72 
 
 		 162 aa  47.8  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0126691  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1258  dTDP-4-dehydrorhamnose epimerase  23.13 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12921  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  24.17 
 
 		 143 aa  45.1  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.197327  hitchhiker  0.00628301 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3385  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  27.78 
 
 		 193 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2655  hypothetical protein  22.76 
 
 		 142 aa  44.3  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6650  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  27.08 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2322  hypothetical protein  24.83 
 
 		 146 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0366  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  33.78 
 
 		 187 aa  42.4  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0651  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  27.68 
 
 		 187 aa  42.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0670  hypothetical protein  22.31 
 
 		 156 aa  41.6  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00975964  normal  0.254699 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>