50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0326 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0006  magnesium chelatase, subunit ChlI  77.02 
 
 		 512 aa  790    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.388384  normal  0.114957 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0370  Mg-chelatase subunit ChlI  65.98 
 
 		 497 aa  669    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.591136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4671  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  64.47 
 
 		 499 aa  669    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  hitchhiker  0.00000156753 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0326  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  100 
 
 		 510 aa  1045    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3739  magnesium chelatase, subunit ChlI  68.19 
 
 		 510 aa  658    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4336  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  62.89 
 
 		 487 aa  622  1e-177  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799132  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08801  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  60.38 
 
 		 487 aa  597  1e-169  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.240112  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2682  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  55.9 
 
 		 505 aa  546  1e-154  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3256  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  46.47 
 
 		 502 aa  422  1e-117  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149717  normal  0.233846 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0412  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  46.38 
 
 		 486 aa  390  1e-107  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1093  magnesium chelatase related protein  48.92 
 
 		 473 aa  385  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1164  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  44.35 
 
 		 475 aa  384  1e-105  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2429  magnesium protoporphyrin chelatase putative  48.14 
 
 		 473 aa  378  1e-103  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1872  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  51.86 
 
 		 464 aa  363  3e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0443  magnesium chelatase subunit ChlI  46.12 
 
 		 475 aa  363  4e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1054  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  44.78 
 
 		 471 aa  349  6e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0934  putative magnesium chelatase  48.4 
 
 		 511 aa  343  5.999999999999999e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.550686  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8559  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  51.21 
 
 		 465 aa  340  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0823  putative magnesium chelatase  50.72 
 
 		 503 aa  338  9.999999999999999e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.421013 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1892  magnesium chelatase, ChlI subunit  43.7 
 
 		 463 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.460358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4854  putative magnesium chelatase  50 
 
 		 463 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.454565 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0952  putative magnesium chelatase subunit ChlI  41.68 
 
 		 462 aa  333  3e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4314  putative magnesium chelatase  48.5 
 
 		 461 aa  333  5e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.569649  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4400  putative magnesium chelatase  48.5 
 
 		 461 aa  333  5e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.803447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4694  putative magnesium chelatase  48.5 
 
 		 461 aa  333  5e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0396421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22300  Mg-chelatase subunit ChlI  49.28 
 
 		 475 aa  331  2e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.102515  normal  0.184518 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3114  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  50.4 
 
 		 469 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.53029  hitchhiker  0.0000243059 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1378  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  39.96 
 
 		 480 aa  327  2.0000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1877  putative magnesium chelatase  48.86 
 
 		 463 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0595129 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10976  magnesium chelatase  49.57 
 
 		 459 aa  324  3e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.915369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1986  putative magnesium chelatase  40.34 
 
 		 469 aa  322  9.999999999999999e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.106493  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1769  putative magnesium chelatase  40.38 
 
 		 478 aa  319  7.999999999999999e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000539061 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2192  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  46.63 
 
 		 461 aa  318  2e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1097  magnesium chelatase, ChlI subunit  47.24 
 
 		 476 aa  318  2e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.3392 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3299  magnesium chelatase subunit ChlI  48.56 
 
 		 473 aa  317  3e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3905  magnesium chelatase, ChlI subunit  49.14 
 
 		 507 aa  311  2e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0246892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0311  magnesium chelatase, ChlI subunit  38.72 
 
 		 460 aa  306  8.000000000000001e-82  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0090  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  38.99 
 
 		 477 aa  296  8e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0551  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  46.11 
 
 		 464 aa  288  1e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1915  ATPase  23.97 
 
 		 304 aa  51.2  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0445  magnesium chelatase  25.78 
 
 		 402 aa  50.4  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0511  ATPase  25.35 
 
 		 334 aa  50.4  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0850  ATPase  27.84 
 
 		 304 aa  50.1  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.243473 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0954  ATPase  26.02 
 
 		 307 aa  49.7  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0799  magnesium chelatase ATPase subunit D  28.19 
 
 		 664 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50740  predicted protein  24.47 
 
 		 800 aa  48.1  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1403  ATPase  27.88 
 
 		 306 aa  47  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3084  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  28.72 
 
 		 678 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4967  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  28.19 
 
 		 672 aa  45.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0776  ATP-dependent protease Lon  37.31 
 
 		 632 aa  43.5  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000293467  unclonable  0.000000000000496506 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>