32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_04660 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_04660  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.321239  normal  0.959578 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0053  tRNA-Ser  92.94 
 
 		 88 bp  121  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451369  hitchhiker  0.000135525 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0008  tRNA-Ser  91.86 
 
 		 89 bp  107  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0009  tRNA-Ser  90.59 
 
 		 88 bp  105  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0008  tRNA-Ser  89.41 
 
 		 88 bp  97.6  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.443501 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0007  tRNA-Ser  89.41 
 
 		 88 bp  97.6  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.846387  normal  0.194729 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0010  tRNA-Ser  89.53 
 
 		 89 bp  91.7  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.314795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0008  tRNA-Ser  89.53 
 
 		 89 bp  91.7  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0052  tRNA-Ser  88.24 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.407966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0008  tRNA-Ser  88.24 
 
 		 88 bp  89.7  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0008  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 89 bp  83.8  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14041  tRNA-Ser  87.21 
 
 		 89 bp  75.8  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.197809 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0054  tRNA-Ser  87.21 
 
 		 86 bp  75.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02690  tRNA-Ser  87.21 
 
 		 86 bp  75.8  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.599018  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0055  tRNA-Ser  87.21 
 
 		 86 bp  75.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0827616  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0011  tRNA-Ser  85.88 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.213585  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0009  tRNA-Ser  85.88 
 
 		 88 bp  73.8  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0010  tRNA-Ser  85.88 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.677549  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0009  tRNA-Ser  86.05 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.503093  normal  0.84111 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0059  tRNA-Ser  86.05 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0162637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25970  tRNA-Ser  95.24 
 
 		 88 bp  67.9  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0053  tRNA-Ser  86.05 
 
 		 89 bp  67.9  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28870  tRNA-Ser  92.86 
 
 		 88 bp  60  0.00000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.132157  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0061  tRNA-Ser  84.88 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0072  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0034  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0054  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.40887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0007  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0004  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60450  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.287736  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0054  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 95 bp  46.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.6985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0039  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>